RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 WNT3P56703 355 aa19.19■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF429Q86V71 674 aa19.19■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 AVPR2P30518 371 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 RPS16P62249 146 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF66Q6ZN08 573 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 RRASP10301 218 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 PMP22Q01453 160 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 KMT5CQ86Y97 462 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 CMTM3Q96MX0 182 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 RAB18Q9NP72 206 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 HGDQ93099 445 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 EDEM2Q9BV94 578 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 GPM6AP51674 278 aa19.18■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 METAP1P53582 386 aa19.18■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 INSL4Q14641 139 aa19.18■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 IL2RAP01589 272 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 GUK1Q16774 197 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 COMMD5Q9GZQ3 224 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 SHISA8B8ZZ34 492 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 PMCHP20382 165 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 OR6S1Q8NH40 331 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC18AA5D8T8 446 aa19.17■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC18CQ8NCF0 446 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa19.17■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 C19orf35Q6ZS72 473 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 PTHLHP12272 177 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 ETFDHQ16134 617 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 TRILQ7L0X0 811 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 TTC9Q92623 222 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 HIST1H3AP68431 136 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 C20orf141Q9NUB4 165 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 MMP24Q9Y5R2 645 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC187A0A096LP49 1063 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 HSBP1O75506 76 aa19.16■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 ZNF793Q6ZN11 406 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 LINC01565O15544 149 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 NDUFB6O95139 128 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 TMEM37Q8WXS4 190 aa19.16■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 PRRG2O14669 202 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 HEXAP06865 529 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 CST2P09228 141 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 FPR2P25090 351 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 ST3GAL2Q16842 350 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 WDR38Q5JTN6 314 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 SARAFQ96BY9 339 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 GPANK1O95872 356 aa19.15■□□□□ 0.66
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PTPRM-211ENST00000580170 FAM24BQ8N5W8 94 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 MMP25Q9NPA2 562 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 ALKBH6Q3KRA9 238 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 MIDNQ504T8 468 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 SMUG1Q53HV7 270 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 GALMQ96C23 342 aa19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 H3BP45 60 aa19.14■□□□□ 0.66
PTPRM-211ENST00000580170 M0R143 59 aa19.14■□□□□ 0.66
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