RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556251.1

RAD51B-223, Transcript of RAD51 paralog B, human

TSL 4

Gene RAD51B, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD51B-223	ENST00000556251		M0QYG6	137 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PLPP2	O43688	288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM20B	O75063	409 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	HMGN1	P05114	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LYN	P07948	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MSMB	P08118	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TACSTD2	P09758	323 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IRF2	P14316	349 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TNFRSF1A	P19438	455 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	HNF1A	P20823	631 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	KITLG	P21583	273 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GIF	P27352	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PMEL	P40967	661 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC15A1	P46059	708 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RGS6	P49758	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC25A1	P53007	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM33	P57088	247 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LMO4	P61968	165 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CSNK2B	P67870	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	OR8B8	Q15620	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MPPED2	Q15777	294 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	HIPK1	Q86Z02	1210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	OR8S1	Q8NH09	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	OR51F2	Q8NH61	342 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PIGC	Q92535	297 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM71F1	Q96KD3	344 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SNX22	Q96L94	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	COG8	Q96MW5	612 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CIB1	Q99828	191 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	APOL4	Q9BPW4	351 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	COPS3	Q9UNS2	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	NF1	P21359	2839 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251		A0A1B0GW55	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CCDC182	A6NF36	153 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DBX1	A6NMT0	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PRR32	B1ATL7	298 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251		B4DSR2	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PPIAL4D	F5H284	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	TMEM178B	H3BS89	294 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	EBAG9	O00559	213 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	EI24	O14681	340 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PLAT	P00750	562 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IFNA2	P01563	188 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	IGHV2-70	P01814	119 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GYPA	P02724	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	EGR1	P18146	543 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GCSH	P23434	173 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LIPA	P38571	399 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	UCP3	P55916	312 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CXCR4	P61073	352 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	BTG1	P62324	171 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ESRRG	P62508	458 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CDK5	Q00535	292 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	SLC3A1	Q07837	685 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	ECH1	Q13011	328 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	MAB21L1	Q13394	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	C4orf46	Q504U0	113 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LCN1P1	Q5VSP4	162 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	FAHD1	Q6P587	224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	DRAM2	Q6UX65	266 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RAD51B-223	ENST00000556251	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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