RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM251Q8N6I4 163 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 NHLRC2Q8NBF2 726 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR2T33Q8NG76 320 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 STARD4Q96DR4 205 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 HSPB2Q16082 182 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR8J1Q8NGP2 316 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AWAT1Q58HT5 328 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 STUMQ69YW2 141 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DRAM2Q6UX65 266 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 CHST4Q8NCG5 386 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 THY1P04216 161 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CD68P34810 354 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A2Q01362 244 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ABCA11PQ4W5N1 156 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TM4SF20Q53R12 229 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RTL6Q6ICC9 239 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR4P4Q8NGL7 312 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 CHST5Q9GZS9 411 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 CCL2P13500 99 aa5.67□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC6A12P48065 614 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF766Q5HY98 468 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CD300LGQ6UXG3 332 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR2W3Q7Z3T1 314 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR5AP2Q8NGF4 316 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR4K15Q8NH41 348 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MOB3AQ96BX8 217 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 PIK3IP1Q96FE7 263 aa5.67□□□□□ -1.5
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