RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543658.5

DDB1-223, Transcript of damage specific DNA binding protein 1, human

TSL 4

Gene DDB1, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB1-223	ENST00000543658	UTS2B	Q765I0	119 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SPERT	Q8NA61	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	RAB2B	Q8WUD1	216 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MSL2	Q9HCI7	577 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		10.16	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	LRRK2	Q5S007	2527 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GPX5	O75715	221 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	MAS1	P04201	325 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	ATF1	P18846	271 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SRM	P19623	302 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	BDKRB2	P30411	391 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	OR10AD1	Q8NGE0	317 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	RNF170	Q96K19	258 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	GPER1	Q99527	375 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	CCL19	Q99731	98 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	DECR2	Q9NUI1	292 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.15	□□□□□ -0.78
DDB1-223	ENST00000543658	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		A0A1W2PPR1	153 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MEGF11	A6BM72	1044 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	OR5B21	A6NL26	309 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	C17orf100	A8MU93	164 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	LILRA1	O75019	489 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GABARAP	O95166	117 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	NAT2	P11245	290 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RANBP1	P43487	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SRP9	P49458	86 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PPOX	P50336	477 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MMP15	P51511	669 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FUT6	P51993	359 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ATP1B3	P54709	279 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMBIM6	P55061	237 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DDI2	Q5TDH0	399 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM42	Q69YG0	159 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DTX2	Q86UW9	622 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ORAI1	Q96D31	301 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CENPO	Q9BU64	300 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TPK1	Q9H3S4	243 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ROS1	P08922	2347 aa		10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	DYSF	O75923	2080 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TENM4	Q6N022	2769 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		A6NLC8	198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TMEM210	A6NLX4	147 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	ZNF732	B4DXR9	585 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658		H0YL77	283 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SLC22A1	O15245	554 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	CYB5A	P00167	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	TNFRSF1A	P19438	455 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RAB3B	P20337	219 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	SERPINB10	P48595	397 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	MTNR1B	P49286	362 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	RBP2	P50120	134 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	PSMD7	P51665	324 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GPM6A	P51674	278 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	VBP1	P61758	197 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	GNG3	P63215	75 aa		10.13	□□□□□ -0.79
DDB1-223	ENST00000543658	UBE2V2	Q15819	145 aa		10.13	□□□□□ -0.79

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