RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533059.5

CHID1-222, Transcript of chitinase domain containing 1, human

TSL 3

Gene CHID1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHID1-222	ENST00000533059	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	C1orf159	Q96HA4	380 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR8B2	Q96RD0	313 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	INPP5E	Q9NRR6	644 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM160	Q9NX00	188 aa		11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	C3orf80	F5H4A9	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	NRAS	P01111	189 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF12	P17014	697 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PMEL	P40967	661 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GPM6A	P51674	278 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CSNK2B	P67870	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LCN2	P80188	198 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF154	Q13106	437 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GALE	Q14376	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF404	Q494X3	552 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CDON	Q4KMG0	1287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	WDR38	Q5JTN6	314 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR52I1	Q8NGK6	324 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LRRC29	Q8WV35	223 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	APH1B	Q8WW43	257 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RORB	Q92753	470 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ITPKC	Q96DU7	683 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PPP1R3E	Q9H7J1	279 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MIOX	Q9UGB7	285 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0G2JMP0	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		A0A0X1KG70	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OOEP	A6NGQ2	149 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		H0YAE9	185 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PLPP2	O43688	288 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	IGLV3-1	P01715	115 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SRD5A1	P18405	259 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MYL12A	P19105	171 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GBX2	P52951	348 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR12D2	P58182	307 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GNB2	P62879	340 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GNG3	P63215	75 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CEACAM21	Q3KPI0	293 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GPR173	Q9NS66	373 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	HSPE1-MOB4	S4R3N1	261 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		V9GYS6	101 aa		11.61	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF732	B4DXR9	585 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059		J3QRE1	110 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	LGALS8	O00214	317 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	CDIPT	O14735	213 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	SERPINA3	P01011	423 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	IFNA2	P01563	188 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	IGHA1	P01876	353 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OCM2	P0CE71	109 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ZNF20	P17024	532 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	THBS2	P35442	1172 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	GMFB	P60983	142 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	MICB	Q29980	383 aa		11.6	□□□□□ -0.55
CHID1-222	ENST00000533059	TMPRSS11A	Q6ZMR5	421 aa		11.6	□□□□□ -0.55

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