RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC18AA5D8T8 446 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A6NNC1 897 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOTOA8MTQ0 251 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF732B4DXR9 585 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALX3O95076 343 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLDN1O95832 211 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADRA2CP18825 462 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALDH3B1P43353 468 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP1B3P54709 279 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MTCP1P56278 107 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HES5Q5TA89 166 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM42Q69YG0 159 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF529Q6P280 563 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CROCCP3Q8IVE0 287 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FBXL14Q8N1E6 418 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC18CQ8NCF0 446 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5A2Q8NGI9 324 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC25A46Q96AG3 418 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BORCS8Q96FH0 119 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPACA5Q96QH8 159 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM204Q9BSN7 226 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC22A4Q9H015 551 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ABCB9Q9NP78 766 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CYSLTR2Q9NS75 346 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAPK2Q9UIK4 370 aa7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRIM64BA6NI03 449 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 B9A039 149 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 H0YL77 283 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPRY3O43610 288 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALDOBP05062 364 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GRPP07492 148 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NAT2P11245 290 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRF1P14222 555 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EVX1P49640 407 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RBP2P50120 134 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF81P51508 661 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GPM6AP51674 278 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MZT1Q08AG7 82 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 P2RY14Q15391 338 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KISS1Q15726 138 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RAB11BQ15907 218 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM255AQ5JRV8 349 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CDH26Q8IXH8 852 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUC15Q8N387 334 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPERTQ8NA61 448 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2Z1Q8NG97 314 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MCFD2Q8NI22 146 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 AP3S1Q92572 193 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RFT1Q96AA3 541 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPSB1Q96BD6 273 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SORCS2Q96PQ0 1159 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 S100A13Q99584 98 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GFI1Q99684 422 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C14orf119Q9NWQ9 140 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ING4Q9UNL4 249 aa7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ESPL1Q14674 2120 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MYO7BQ6PIF6 2116 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0G2JK05 382 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR5B21A6NL26 309 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFITM5A6NNB3 132 aa7.25□□□□□ -1.25
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F5H5P2 479 aa7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms