RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM106AQ96A25 262 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 FBXO7Q9Y3I1 522 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 RCBTB2O95199 551 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 CYB5AP00167 134 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 MC3RP41968 323 aa8.97□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 ERVFRD-1P60508 538 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 PARP11Q9NR21 331 aa8.96□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
TRPS1-211ENST00000520276 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.96□□□□□ -0.97
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TRPS1-211ENST00000520276 EFSO43281 561 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-211ENST00000520276 CCL11P51671 97 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-211ENST00000520276 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 CT55Q8WUE5 264 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-211ENST00000520276 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-211ENST00000520276 TRGC1P0CF51 173 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 NPIPA8P0DM63 369 aa8.95□□□□□ -0.98
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TRPS1-211ENST00000520276 ADAM8P78325 824 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 TOMM20Q15388 145 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 THNSL2Q86YJ6 484 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 JAGN1Q8N5M9 183 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 PLPP7Q8NBV4 271 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.95□□□□□ -0.98
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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