RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513331.1

GFM2-208, Transcript of G elongation factor mitochondrial 2, human

TSL 2

Gene GFM2, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GFM2-208	ENST00000513331	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PITX2	Q99697	317 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GPA33	Q99795	319 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MED10	Q9BTT4	135 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SEC11C	Q9BY50	192 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ABCB9	Q9NP78	766 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LHX9	Q9NQ69	397 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MIEF1	Q9NQG6	463 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	VNN3	Q9NY84	501 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	AHSP	Q9NZD4	102 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PSORS1C1	Q9UIG5	152 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TET1	Q8NFU7	2136 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LRIT2	A6NDA9	550 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		F8VVB4	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		F8VWA3	439 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GNGT2	O14610	69 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	KDELR3	O43731	214 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LANCL1	O43813	399 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RDH16	O75452	317 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	VAMP5	O95183	116 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A27	O95847	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MELTF	P08582	738 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GKN3P	P0CG01	181 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	IL1RN	P18510	177 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CXCL2	P19875	107 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GPX3	P22352	226 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	GABRR1	P24046	479 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CD200	P41217	278 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	P2RY2	P41231	377 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CDKN2B	P42772	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ATRX	P46100	2492 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RGS4	P49798	205 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PPT1	P50897	306 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TDGF1P3	P51864	188 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	BDH1	Q02338	343 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	NFATC2	Q13469	925 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RSU1	Q15404	277 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LPAL2	Q16609	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	IFI44L	Q53G44	452 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LEMD1	Q68G75	181 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LCLAT1	Q6UWP7	414 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TMUB2	Q71RG4	321 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SPIC	Q8N5J4	248 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PQLC3	Q8N755	202 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	UBAC2	Q8NBM4	344 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	BEST4	Q8NFU0	473 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR2T35	Q8NGX2	323 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	TERB2	Q8NHR7	220 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	ULK4	Q96C45	1275 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC58	Q96CX6	371 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	DTD2	Q96FN9	168 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	S100A13	Q99584	98 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RBBP8	Q99708	897 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	OMD	Q99983	421 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LRRC61	Q9BV99	259 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		3.74	□□□□□ -1.81
GFM2-208	ENST00000513331	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81

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