RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505700.1

HOXC-AS1-201, HOXC cluster antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS1, Length 548 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SEH1LQ96EE3 360 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PKP2Q99959 881 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MROQ9BYG7 248 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRRG3Q9BZD7 231 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TLNRD1Q9H1K6 362 aa19.32■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM210A6NLX4 147 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MAP2K3P46734 347 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RASSF2P50749 326 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ARF6P62330 175 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ESRRGP62508 458 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DEGS2Q6QHC5 323 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COMMD2Q86X83 199 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR5T2Q8NGG2 359 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TBX15Q96SF7 602 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 KRT84Q9NSB2 600 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DNAJB11Q9UBS4 358 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa19.31■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A1B0GW55 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CCDC182A6NF36 153 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ACOD1A6NK06 481 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SRRM5B3KS81 715 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 G3V2T6 193 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRKYO43930 277 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FCN3O75636 299 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L2P0CJ85 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L3P0CJ86 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L4P0CJ87 422 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L5P0CJ88 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L6P0CJ89 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L7P0CJ90 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MMP9P14780 707 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SCCPDHQ8NBX0 429 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TTTY10Q9BZA0 68 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNTD2Q9H8S5 307 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DUX4Q9UBX2 424 aa19.3■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NDUFB3O43676 98 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MITFO75030 526 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF254O75437 659 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PDCD1Q15116 288 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ATP6AP1Q15904 470 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C16orf87Q6PH81 154 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGFRL1Q8N441 504 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM216BQ8N7L0 139 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR10Z1Q8NGY1 313 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SGMS2Q8NHU3 365 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GATAD2BQ8WXI9 593 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ASB17Q8WXJ9 295 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LHX4Q969G2 390 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF747Q9BV97 191 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SIRPDQ9H106 197 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TNFRSF19Q9NS68 423 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 SNTG1Q9NSN8 517 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM206AQ9NX38 181 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HAO2Q9NYQ3 351 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IKZF2Q9UKS7 526 aa19.29■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 A0A0U1RQV5 110 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 GPM6AP51674 278 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 RIDAP52758 137 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 IKZF1Q13422 519 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 THAP5Q7Z6K1 395 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF679Q8IYX0 411 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 TCEANCQ8N8B7 351 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR8B4Q96RC9 309 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PBOV1Q9GZY1 135 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 WDR13Q9H1Z4 485 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 PRDM13Q9H4Q3 707 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 NOX4Q9NPH5 578 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 COPS3Q9UNS2 423 aa19.28■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 M0R129 80 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 AKR7A2O43488 359 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FASP25445 335 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 DCTDP32321 178 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ROM1Q03395 351 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 LRRC10Q5BKY1 277 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM76BQ5HYJ3 339 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 C1orf146Q5VVC0 180 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 OR51E1Q8TCB6 317 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 HPSE2Q8WWQ2 592 aa19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
HOXC-AS1-201ENST00000505700 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms