RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	YIPF1	Q9Y548	306 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	GLOD5	A6NK44	160 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	LEFTY2	O00292	366 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RAB29	O14966	203 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	COCH	O43405	550 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1QL1	O75973	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RGR	P47804	291 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	RND3	P61587	244 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	BSX	Q3C1V8	233 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	CHST9	Q7L1S5	443 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	PTPMT1	Q8WUK0	201 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	WSB2	Q9NYS7	404 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TMEM229A	B2RXF0	380 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DIRC3	C9JPN6	131 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		M0R1X1	148 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TBX18	O95935	607 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC3B	P05452	202 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TDGF1	P13385	188 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPS4Y1	P22090	263 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP8	Q13202	625 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MMD	Q15546	238 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR1Q1	Q15612	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP5	Q16690	384 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HIST3H3	Q16695	136 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PHF19	Q5T6S3	580 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RBKS	Q9H477	322 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PADI3	Q9ULW8	664 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HHLA2	Q9UM44	414 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRP5L	A4QPB2	252 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EP13	123 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	NDUFS4	O43181	175 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	IL2RA	P01589	272 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CEACAM1	P13688	526 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HTD2	P86397	168 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	HGFAC	Q04756	655 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MED25	Q71SY5	747 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CAPNS2	Q96L46	248 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARHGDIG	Q99819	225 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ELN	P15502	786 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ALOX5AP	P20292	161 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	PSMB3	P49720	205 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF136	P52737	540 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	TAF10	Q12962	218 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	AGBL4	Q5VU57	503 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q7L0L9	218 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CBARP	Q8N350	705 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF128	Q8TEB7	428 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	RNF126	Q9BV68	326 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	CST9L	Q9H4G1	147 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SMCHD1	A6NHR9	2005 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	XRCC2	O43543	280 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	MPIG6B	O95866	241 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	SOD2	P04179	222 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF823	P16415	610 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	DUSP1	P28562	367 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CRNKL1-205	ENST00000496549	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24

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