RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495044.5

CCDC30-211, Transcript of coiled-coil domain containing 30, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC30, Length 2,021 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30-211ENST00000495044 OR5D13Q8NGL4 314 aa5.96□□□□□ -1.45
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CCDC30-211ENST00000495044 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.95□□□□□ -1.46
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CCDC30-211ENST00000495044 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
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CCDC30-211ENST00000495044 HSD17B1P14061 328 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 TGM4P49221 684 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 KRTAP10-11P60412 298 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 TAF13Q15543 124 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 PLA1AQ53H76 456 aa5.94□□□□□ -1.46
CCDC30-211ENST00000495044 DRAM2Q6UX65 266 aa5.94□□□□□ -1.46
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CCDC30-211ENST00000495044 VTCN1Q7Z7D3 282 aa5.94□□□□□ -1.46
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