RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNA6P05013 189 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CD79AP11912 226 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PTNP21246 168 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EPHA1P21709 976 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NME2P22392 152 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HTR2CP28335 458 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRA5P31644 462 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DNASE1L1P49184 302 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TPBGQ13641 420 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF345Q14585 488 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SGCBQ16585 318 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HYAL4Q2M3T9 481 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BAP18Q8IXM2 172 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2M7Q8NG81 312 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A28Q96A46 364 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TVP23BQ9NYZ1 205 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GJE1A6NN92 205 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FTCDNL1E5RQL4 147 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R2P9O14990 202 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK10O43240 276 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TGOLN2O43493 480 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ACTL6AO96019 429 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PNPP00491 289 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SFTPBP07988 381 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SP1P08047 785 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EPXP11678 715 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DTYMKP23919 212 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1C2P52895 323 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFA6P56556 154 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1C1Q04828 323 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LTBQ06643 244 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZP4Q12836 540 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT14P1Q58G82 188 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EMC4Q5J8M3 183 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ACBD4Q8NC06 268 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51A7Q8NH64 312 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 THRSPQ92748 146 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 EXTL1Q92935 676 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT2BQ93097 391 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRG7Q96K78 797 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CMC2Q9NRP2 79 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR173Q9NS66 373 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DEPPQ9NTK1 212 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ALKBH4Q9NXW9 302 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KPTNQ9Y664 436 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 V9GYS6 101 aa6.4□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0G2JMM0 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPB8 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPH5 198 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PRS3 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IRGMA1A4Y4 181 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NIZ1 184 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR3DP1A8MWS1 328 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PHOX2AO14813 284 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 SIAH2O43255 324 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF13O43567 381 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ZIC3O60481 467 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 GLCEO94923 617 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2F2O95006 317 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 FARS2O95363 451 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 TXNDC12O95881 172 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHMP01871 453 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 F13BP05160 661 aa6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
SMARCE1-211ENST00000493660 ACHEP22303 614 aa6.39□□□□□ -1.39
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