RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 GPER1Q99527 375 aa11.3□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 MOB1AQ9H8S9 216 aa11.3□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.29□□□□□ -0.6
PRAME-213ENST00000492657 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa11.29□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa11.29□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 OR14L1PQ8NHC6 308 aa11.27□□□□□ -0.6
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PRAME-213ENST00000492657 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
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PRAME-213ENST00000492657 CASTOR1Q8WTX7 329 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 CT55Q8WUE5 264 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 RAB3CQ96E17 227 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 TMEM59Q9BXS4 323 aa11.27□□□□□ -0.61
PRAME-213ENST00000492657 DEPPQ9NTK1 212 aa11.27□□□□□ -0.61
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