RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492262.1

ZNF638-223, Transcript of zinc finger protein 638, human

TSL 2

Gene ZNF638, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF638-223	ENST00000492262	ST8SIA1	Q92185	356 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		Q96M85	177 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KCTD7	Q96MP8	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LPAR4	Q99677	370 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MARCH7	Q9H992	704 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NANS	Q9NR45	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KCNG2	Q9UJ96	466 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXL4	Q9UKA2	621 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MOK	Q9UQ07	419 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	KNTC1	P50748	2209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IGHV1-45	A0A0A0MS14	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MSGN1	A6NI15	193 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		A8MVM7	634 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LRRTM2	O43300	516 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	BUB3	O43684	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZFAND5	O76080	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NGF	P01138	241 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	GYPB	P06028	91 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	UMOD	P07911	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	YES1	P07947	543 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SPI1	P17947	270 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CEL	P19835	753 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CFL1	P23528	166 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CXCR1	P25024	350 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ITGA3	P26006	1051 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SRD5A2	P31213	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FBXW4	P57775	412 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ACTA2	P62736	377 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ERVK-25	P63136	954 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ACTG2	P63267	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CDC20	Q12834	499 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PPA1	Q15181	289 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	QPRT	Q15274	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TAF13	Q15543	124 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MEST	Q5EB52	335 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	LEG1	Q6P5S2	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SSX6	Q7RTT6	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SYT14	Q8NB59	555 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	OR5J2	Q8NH18	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	ZPLD1	Q8TCW7	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TMEM234	Q8WY98	164 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PPP1R14B	Q96C90	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	RASD2	Q96D21	266 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CNN2	Q99439	309 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SPX	Q9BT56	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FANCF	Q9NPI8	374 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		R4GN57	208 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		V9GYH0	126 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	DNAJC13	O75165	2243 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	SPEG	Q15772	3267 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	MED12L	Q86YW9	2145 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	VCAN	P13611	3396 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ZNF638-223	ENST00000492262	P2RY10	O00398	339 aa		4.56	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms