RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 Q6ZS46 218 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM219Q86XT9 240 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LRRC29Q8WV35 223 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GPR61Q9BZJ8 451 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MUC13Q9H3R2 512 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SPAG4Q9NPE6 437 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ADA2Q9NZK5 511 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 KCNG2Q9UJ96 466 aa11.17□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CSMD3Q7Z407 3707 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1W2PQ09 198 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 IDH3BO43837 385 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GADD45GO95257 159 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SEMG1P04279 462 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC159P0C7I6 412 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 AMY2BP19961 511 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ANOS1P23352 680 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SMIM11AP58511 58 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SPIBQ01892 262 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF92Q03936 586 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 BLMHQ13867 455 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SNAI3Q3KNW1 292 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR5D13Q8NGL4 314 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR2AE1Q8NHA4 323 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SPTSSAQ969W0 71 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ASCL2Q99929 193 aa11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GGT3PA6NGU5 568 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 H0YAE9 185 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 SYNGR1O43759 233 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 ZFPL1O95159 310 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 CLIC3O95833 236 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PAICSP22234 425 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 POU1F1P28069 291 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RPS27P42677 84 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GSSP48637 474 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RAB13P51153 203 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 PLA1AQ53H76 456 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 C11orf53Q8IXP5 236 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00482Q8N8I6 264 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 OR5T2Q8NGG2 359 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TCF19Q9Y242 345 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 V9GYQ6 96 aa11.15□□□□□ -0.62
ATG4B-222ENST00000491867 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 GMNNO75496 209 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 PSKH1P11801 424 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 LYL1P12980 280 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF823P16415 610 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 IFNGR2P38484 337 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 BLCAPP62952 87 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 MZT1Q08AG7 82 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 GLYATL3Q5SZD4 288 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 DRAM2Q6UX65 266 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 LNX2Q8N448 690 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 RNF148Q8N7C7 305 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 PROKR2Q8NFJ6 384 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 MYDGFQ969H8 173 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 CMTM5Q96DZ9 223 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 PYURFQ96I23 114 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 A6NDX4 124 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 VGLL3A8MV65 326 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 BHLHE40O14503 412 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 TFF1P04155 84 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 ALDOBP05062 364 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFB7P17568 137 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 PYCR1P32322 319 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 GRK5P34947 590 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 GMFBP60983 142 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 CSNK2BP67870 215 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 TSPAN31Q12999 210 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 STUMQ69YW2 141 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 LYPD4Q6UWN0 246 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 CYB561A3Q8NBI2 242 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 OR56B2PQ8NGI1 322 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 OR4C15Q8NGM1 316 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 OR2T4Q8NH00 348 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 COPS4Q9BT78 406 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 OPA3Q9H6K4 179 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF391Q9UJN7 358 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-222ENST00000491867 CDH10Q9Y6N8 788 aa11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms