RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 STARD10Q9Y365 291 aa6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PPW3 197 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GGT3PA6NGU5 568 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SHISA9B4DS77 424 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CLDN1O95832 211 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 HLA-DPB1P04440 258 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ISG15P05161 165 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OCM2P0CE71 109 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GADD45AP24522 165 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GLRXP35754 106 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SOX2P48431 317 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ERVS71-1P61550 626 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF92Q03936 586 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 Q499Y3 187 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SATL1Q86VE3 508 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 RDH10Q8IZV5 341 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FTMTQ8N4E7 242 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ACBD4Q8NC06 268 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OR10AC1Q8NH08 325 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SPSB4Q96A44 273 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 YIPF6Q96EC8 236 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 LYZL4Q96KX0 146 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OR14A2Q96R54 314 aa6.56□□□□□ -1.36
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GARNL3-218ENST00000487565 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CA10Q9NS85 328 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF319Q9P2F9 582 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CKLFQ9UBR5 152 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FZR1Q9UM11 496 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SSR3Q9UNL2 185 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CMAHPQ9Y471 501 aa6.56□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1B0GTI1 187 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC160A6NGH7 325 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 A6NNC1 897 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CD300LBA8K4G0 201 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 VSTM5A8MXK1 200 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF879B4DU55 563 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GABRPO00591 440 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 AIREO43918 545 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GATBO75879 557 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ARL6IP5O75915 188 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GABARAPO95166 117 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 IGLV3-1P01715 115 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MYL9P24844 172 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 THBS4P35443 961 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GNALP38405 381 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MPV17P39210 176 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SELENOVP59797 346 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 PPP3R1P63098 170 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FAM3AP98173 230 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FABP5Q01469 135 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OR8B8Q15620 311 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 GPR107Q5VW38 600 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 PAMR1Q6UXH9 720 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 BHLHE23Q8NDY6 225 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SYNPRQ8TBG9 265 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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GARNL3-218ENST00000487565 TMEM106AQ96A25 262 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TMIGD2Q96BF3 282 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SGK3Q96BR1 496 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 C8orf49Q96NF6 230 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ENPP5Q9UJA9 477 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 V9GYS6 101 aa6.55□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 PLSCR5A0PG75 271 aa6.54□□□□□ -1.36
GARNL3-218ENST00000487565 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.54□□□□□ -1.36
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