RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 FUT3P21217 361 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PCMT1P22061 227 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RAC3P60763 192 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GAB4Q2WGN9 574 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF774Q6NX45 483 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZAR1Q86SH2 424 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 EDARADDQ8WWZ3 215 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 AP1S3Q96PC3 154 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 QPCTLQ9NXS2 382 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GIPP09681 153 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PSMB6P28072 239 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GALNSP34059 522 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF83P51522 516 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GPM6AP51674 278 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RAB35Q15286 201 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CD300LDQ6UXZ3 194 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF416Q9BWM5 594 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SRRQ9GZT4 340 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 DLL4Q9NR61 685 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SERPINE3A8MV23 424 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 RGS13O14921 159 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GMDSO60547 372 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TRAPPC2P0DI81 140 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TRAPPC2BP0DI82 140 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 M6PRP20645 277 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MAGEB1P43366 347 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF85Q03923 595 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 UBALD1Q8TB05 177 aa11.94□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TSPAN32Q96QS1 320 aa11.94□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 OR8U8P0C7N1 319 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SLC37A1P57057 533 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 BTN1A1Q13410 526 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PDCD1Q15116 288 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CREB3L2Q70SY1 520 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FAM109AQ8N4B1 249 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 HES7Q9BYE0 225 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FAM117AQ9C073 453 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR5H14A6NHG9 310 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PLPP2O43688 288 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LYZL6O75951 148 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C1QBP02746 253 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR4E1P0C645 316 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PTHLHP12272 177 aa11.93□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 INSL4Q14641 139 aa11.93□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 OR2G3Q8NGZ4 309 aa11.93□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 RNF32Q9H0A6 362 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PLPP3O14495 311 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LALBAP00709 142 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ADRA2CP18825 462 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TNFRSF1AP19438 455 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FUT7Q11130 342 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 Q6ZRG5 221 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 THNSL2Q86YJ6 484 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C10orf111Q8N326 155 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 COMMD5Q9GZQ3 224 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OPA3Q9H6K4 179 aa11.93□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 KRBOX1C9JBD0 128 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 F6UZH7 168 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SSX4O60224 188 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP11.92□□□□□ -0.58e-6■■■□□ 15.4
HDLBP-241ENST00000487169 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 PIGPP57054 158 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR2Z1Q8NG97 314 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 OR8U1Q8NH10 309 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TERB2Q8NHR7 220 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 C12orf10Q9HB07 376 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 MPZL1O95297 269 aa11.92□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.92□□□□□ -0.5
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HDLBP-241ENST00000487169 OR4S1Q8NGB4 309 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 EXTL1Q92935 676 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FOXJ3Q9UPW0 622 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP92A6NM28 416 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 TERTO14746 1132 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 FOXS1O43638 330 aa11.92□□□□□ -0.5
HDLBP-241ENST00000487169 LRP3O75074 770 aa11.92□□□□□ -0.5
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