RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 DRAM2Q6UX65 266 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC16A9Q7RTY1 509 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DCXRQ7Z4W1 244 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CMTM4Q8IZR5 234 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR8S1Q8NH09 359 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR5R1Q8NH85 324 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FANK1Q8TC84 345 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GAFA1Q96PS6 74 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ15Q99712 375 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MMP28Q9H239 520 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MAB21L2Q9Y586 359 aa6.86□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TBX1O43435 398 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 IDH3BO43837 385 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CHST1O43916 411 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 COX4I1P13073 169 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GRK5P34947 590 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DDOSTP39656 456 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GSSP48637 474 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MZT1Q08AG7 82 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00471Q8N535 108 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SGCDQ92629 289 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 COPS4Q9BT78 406 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 EGLN3Q9H6Z9 239 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SP140LQ9H930 580 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 AP3M1Q9Y2T2 418 aa6.85□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 M0R1W7 72 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 AKR7A2O43488 359 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GADD45GO95257 159 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SEMG1P04279 462 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GYPBP06028 91 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SPARCP09486 303 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CLUP10909 449 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NDUFB7P17568 137 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 POU1F1P28069 291 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 RAB13P51153 203 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MXRA7P84157 204 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ACSM1Q08AH1 577 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 TAF13Q15543 124 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PRSS45Q7RTY3 260 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 MKXQ8IYA7 352 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC37A3Q8NCC5 494 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PROKR2Q8NFJ6 384 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR51G2Q8NGK0 314 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 PHF21AQ96BD5 680 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 REEP6Q96HR9 211 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF702PQ9H963 129 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 V9GYQ6 96 aa6.84□□□□□ -1.31
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 DHRS12A0PJE2 317 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD34BA5PLL1 514 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 SIGLEC5O15389 551 aa6.83□□□□□ -1.32
CTPS1-208ENST00000479480 XRCC2O43543 280 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms