RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 PAX6P26367 422 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 NMUP48645 174 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL14P50914 215 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB38P57729 211 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 INCA1Q0VD86 236 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS8Q16651 343 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL5Q5H9L2 206 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXW9Q5XUX1 488 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 GTSCR1Q86UQ5 136 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 GAPTQ8N292 157 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C19orf18Q8NEA5 215 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJB3Q8WWF6 145 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TCEAL3Q969E4 200 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ITFG2Q969R8 447 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 WDR34Q96EX3 536 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RSG1Q9BU20 258 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TOLLIPQ9H0E2 274 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ANXA10Q9UJ72 324 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF225Q9UK10 706 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MYL12BO14950 172 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 FABP7O15540 132 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CRXO43186 299 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 AHSA1O95433 338 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 GTF2H1P32780 548 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CXCL5P42830 114 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TAS2R31P59538 309 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZTC4 211 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LGI3Q8N145 548 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DCAF4L2Q8NA75 395 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LFNGQ8NES3 379 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2L5Q8NG80 312 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10G6Q8NH81 332 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1S1Q8NH92 325 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RXFP4Q8TDU9 374 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 HBEGFQ99075 208 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 UCK1Q9HA47 277 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RDH14Q9HBH5 336 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCB9Q9NP78 766 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SDHAF3Q9NRP4 125 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SIGLEC7Q9Y286 467 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ORC6Q9Y5N6 252 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SCN2AQ99250 2005 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ASTN1O14525 1302 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8KD6RF30 607 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8MH3BSY2 632 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CD5LO43866 347 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MPZL2O60487 215 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB36O95755 333 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ORM1P02763 201 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV4-34P06331 123 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMS3P0CW19 117 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LIMS4P0CW20 117 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PSKH1P11801 424 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB25P24278 435 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 SSTR5P35346 364 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOAP61586 193 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 MED21Q13503 144 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 LPAL2Q16609 132 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TTC32Q5I0X7 151 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM255AQ5JRV8 349 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 AVPI1Q5T686 147 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM236Q5W0B7 351 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 NIPAL1Q6NVV3 410 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 PIFOQ8TCI5 191 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ABHD3Q8WU67 409 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 RDH5Q92781 318 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 EMC6Q9BV81 110 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TMED9Q9BVK6 235 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 C12orf4Q9NQ89 552 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 KIAA0232Q92628 1395 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 J3QLI3 93 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 TCAPO15273 167 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV1D-16P01601 117 aa4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms