RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472326.2

SGCE-210, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 2

Gene SGCE, Length 453 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF10O15013 1369 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 AP3B1O00203 1094 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MFNGO00587 321 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 IGLV6-57P01721 117 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CALRP27797 417 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 DEGS2Q6QHC5 323 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SGPP2Q8IWX5 399 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 OR5K2Q8NHB8 316 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ZNF606Q8WXB4 792 aa2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CACNA1AO00555 2505 aa2.87□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 OR2AG2A6NM03 316 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GABRPO00591 440 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 GLAP06280 429 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TBPL2Q6SJ96 375 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MDP1Q86V88 176 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SLC38A4Q969I6 547 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 HAUS1Q96CS2 278 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TMEM165Q9HC07 324 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SLC39A1Q9NY26 324 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 COL24A1Q17RW2 1714 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 DUOX2Q9NRD8 1548 aa2.87□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ARHGEF5Q12774 1597 aa2.87□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 UNC80Q8N2C7 3258 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PKD1L3Q7Z443 1732 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 C9JVG2 144 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 FTH1P02794 183 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MT-ND4P03905 459 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 BCKDHBP21953 392 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ERO1BQ86YB8 467 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 HGDQ93099 445 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 RASD2Q96D21 266 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ZNF442Q9H7R0 627 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SBNO1A3KN83 1393 aa2.86□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SSH2Q76I76 1423 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 QSER1Q2KHR3 1735 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PEAK1Q9H792 1746 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ATP7BP35670 1465 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA8OA6NCC3 632 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 GOLGA8NF8WBI6 632 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 LSM8O95777 96 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 MPV17P39210 176 aa2.85□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 RTL4Q6ZR62 310 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 OR2Z1Q8NG97 314 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 KCNS1Q96KK3 526 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TM2D3Q9BRN9 247 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 C20orf24Q9BUV8 137 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 NEK6Q9HC98 313 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MMACHCQ9Y4U1 282 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PAPPAQ13219 1627 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP2.85□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 KIAA0232Q92628 1395 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 HFM1A2PYH4 1435 aa2.85□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 AKAP12Q02952 1782 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TAAR5O14804 337 aa2.84□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 PGA5P0DJD9 388 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 MYL2P10916 166 aa2.84□□□□□ -1.95
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SGCE-210ENST00000472326 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 C19orf18Q8NEA5 215 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 OR9G4Q8NGQ1 327 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 C1orf50Q9BV19 199 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 LRRC42Q9Y546 428 aa2.84□□□□□ -1.95
SGCE-210ENST00000472326 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP2.84□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 NAIPQ13075 1403 aa2.84□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 VCANP13611 3396 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PIK3C2AO00443 1686 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 FMN2Q9NZ56 1722 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 A6NDN8 102 aa2.83□□□□□ -1.96
SGCE-210ENST00000472326 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa2.83□□□□□ -1.96
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