RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 OR5B2Q96R09 309 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PARP11Q9NR21 331 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.06□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 H0YGG7 62 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 H0YL77 283 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TMEM127O75204 238 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 SERPINA2P20848 420 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 S1PR1P21453 382 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CST6Q15828 149 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 FGF22Q9HCT0 170 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PARPBPQ9NWS1 579 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 LUZP4Q9P127 313 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 OR6A2O95222 327 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SFT2D2O95562 160 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 MBP02144 154 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 JMJD7P0C870 316 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SMIM10L1P0DMW3 83 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RAP1AP62834 184 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TMEM156Q8N614 296 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 OR9A4Q8NGU2 314 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TCTN2Q96GX1 697 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SMIM10Q96HG1 83 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 REEP6Q96HR9 211 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 GPR132Q9UNW8 380 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 DNAJC13O75165 2243 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 FRYLO94915 3013 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 SERINC4A6NH21 518 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 K7EPK0 472 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 IFNA17P01571 189 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ASAH2BP0C7U1 165 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 BCKDHBP21953 392 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CRABP1P29762 137 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TAS2R60P59551 318 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 NFATC4Q14934 902 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TMEM52BQ4KMG9 183 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PRR22Q8IZ63 422 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 YPEL4Q96NS1 127 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TUBA4BQ9H853 241 aa7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CENPMQ9NSP4 180 aa7.05□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 H0Y8X5 98 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 DIRAS3O95661 229 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RENP00797 406 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CT45A8P0DMV1 189 aa7.04□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CAMLGP49069 296 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 BTG2P78543 158 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 CT45A2Q5DJT8 189 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 MED25Q71SY5 747 aa7.04□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 A6NJ64 397 aa7.04□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 H0YIG0 161 aa7.04□□□□□ -1.28
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TPM3-215ENST00000469717 CFPP27918 469 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 PMELP40967 661 aa7.04□□□□□ -1.28
TPM3-215ENST00000469717 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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