RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467435.1

HDLBP-231, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 2

Gene HDLBP, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-231	ENST00000467435	BCAP31	P51572	246 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR176	Q14439	515 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MOB3C	Q70IA8	216 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ACBD4	Q8NC06	268 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5L1	Q8NGL2	311 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PIGC	Q92535	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GHRL	Q9UBU3	117 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GPR160	Q9UJ42	338 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ACACA	Q13085	2346 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MEIOC	A2RUB1	952 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CENPX	A8MT69	81 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ORC5	O43913	435 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SMPD2	O60906	423 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SCGN	O76038	276 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	AGFG2	O95081	481 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MPIG6B	O95866	241 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	IL32	P24001	234 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PTGFR	P43088	359 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ALDH3B1	P43353	468 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KIR2DL3	P43628	341 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MTCP1	P56278	107 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZP1	P60852	638 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RBPJ	Q06330	500 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KLRB1	Q12918	225 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ITPKC	Q96DU7	683 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	S100A13	Q99584	98 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	C7orf50	Q9BRJ6	194 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM59	Q9BXS4	323 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CST11	Q9H112	138 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MMP28	Q9H239	520 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TINAG	Q9UJW2	476 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A1W2PP11	408 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OR5H1	A6NKK0	313 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ICMT	O60725	284 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CST4	P01036	141 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	IGKV3-15	P01624	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NAT2	P11245	290 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SERPINA2	P20848	420 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PRSS3	P35030	304 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	OPRM1	P35372	400 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	RBP2	P50120	134 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ATP1B3	P54709	279 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	AP3S2	P59780	193 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GUCA2A	Q02747	115 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PRDX4	Q13162	271 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FTMT	Q8N4E7	242 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	TMEM104	Q8NE00	496 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	FAM122A	Q96E09	287 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PIGM	Q9H3S5	423 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	BANF2	Q9H503	90 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	SVIL	O95425	2214 aa		10.6	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0A6YYD4	124 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD20A5P	A0PJZ0	165 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	CD300LB	A8K4G0	201 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDLBP-231	ENST00000467435	EEF1E1-BLOC1S5	C9J1V9	151 aa		10.59	□□□□□ -0.71

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