RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PHYHD1Q5SRE7 291 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 C1QL2Q7Z5L3 287 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 CDC6Q99741 560 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PLEK2Q9NYT0 353 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.1■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 G3V3Y1 287 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 DHHO43323 396 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 IGLV3-1P01715 115 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 APOC1P02654 83 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 LIFP15018 202 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PPIAP62937 165 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM156Q8N614 296 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 OR9K2Q8NGE7 335 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM54Q969K7 222 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM230Q96A57 120 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 UCN2Q96RP3 112 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 ANGPTL4Q9BY76 406 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 RAB18Q9NP72 206 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 EHFQ9NZC4 300 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.09■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 C9J4A7 227 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 M0R135 149 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 GP1BAP07359 652 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 ALDH3B1P43353 468 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2V2Q15819 145 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PIK3IP1Q96FE7 263 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF799Q96GE5 643 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 ULBP2Q9BZM5 246 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 CHST5Q9GZS9 411 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 V9GYS6 101 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 PI4KAP42356 2102 aa16.08■□□□□ 0.17
SYNE4-204ENST00000465425 CFIP05156 583 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 UMODP07911 640 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 COX6A1P12074 109 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CPT2P23786 658 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF84P51523 738 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ARL6IP1Q15041 203 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 Q7L0L9 218 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR5AP2Q8NGF4 316 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SPTSSAQ969W0 71 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NABP1Q96AH0 204 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CYYR1Q96J86 154 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 IMMP1LQ96LU5 166 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF700Q9H0M5 742 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PIGMQ9H3S5 423 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C12orf4Q9NQ89 552 aa16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SERPINE3A8MV23 424 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ADAP1O75689 374 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NAT2P11245 290 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 DEFA5Q01523 94 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 CHRFAM7AQ494W8 412 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 OR13G1Q8NGZ3 307 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MAFIPQ8WZ33 124 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HAS2Q92819 552 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PECRQ9BY49 303 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HPF1Q9NWY4 346 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PILRBQ9UKJ0 227 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HPNP05981 417 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MC2RQ01718 297 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PMS2CLQ68D20 193 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 LHFPL1Q86WI0 220 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM123Q8N131 208 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 M1APQ8TC57 530 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PAQR8Q8TEZ7 354 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PIGTQ969N2 578 aa16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0B4J2A0 478 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 TNFSF11O14788 317 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZIC3O60481 467 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 DBHP09172 617 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF273Q14593 569 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 AADACL3Q5VUY0 350 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 AGBL5Q8NDL9 886 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 STOML3Q8TAV4 291 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf35Q96D05 121 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 MICU1Q9BPX6 476 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PRR13Q9NZ81 148 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 SHPKQ9UHJ6 478 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHB10Q9UN67 800 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.06■□□□□ 0.16
SYNE4-204ENST00000465425 EML6Q6ZMW3 1958 aa16.06■□□□□ 0.16
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