RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 MTNR1BP49286 362 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF81P51508 661 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MMP15P51511 669 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMD7P51665 324 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PRDX4Q13162 271 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8G1Q15617 311 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MST1LQ2TV78 715 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CEACAM21Q3KPI0 293 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MOB3CQ70IA8 216 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DTX2Q86UW9 622 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM200AQ86VY9 491 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DNAAF1Q8NEP3 725 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR1M1Q8NGA1 313 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8S1Q8NH09 359 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SPSB1Q96BD6 273 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MICU1Q9BPX6 476 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 UBTD1Q9HAC8 227 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SNTG1Q9NSN8 517 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R4Q9NYW5 299 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa8.02□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1B0GWJ7 208 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A1W2PPR1 153 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DPPA5A6NC42 116 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5B21A6NL26 309 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 LILRA1O75019 489 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ALDOBP05062 364 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ADH4P08319 380 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 BDKRB2P30411 391 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ALDH3B1P43353 468 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 FUT6P51993 359 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2V2Q15819 145 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SWI5Q1ZZU3 235 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PCGF3Q3KNV8 242 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM255AQ5JRV8 349 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF529Q6P280 563 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 Q6ZR03 302 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TPRA1Q86W33 373 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CDH26Q8IXH8 852 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR2Z1Q8NG97 314 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR13C9Q8NGT0 318 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 OR5P3Q8WZ94 311 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MARVELD3Q96A59 401 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ISOC1Q96CN7 298 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ELMOD3Q96FG2 381 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 BORCS8Q96FH0 119 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF170Q96K19 258 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CENPOQ9BU64 300 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 RTL8AQ9BWD3 113 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MSL2Q9HCI7 577 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 GPR173Q9NS66 373 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 C14orf119Q9NWQ9 140 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 COL12A1Q99715 3063 aa8.01□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM210A6NLX4 147 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 C17orf100A8MU93 164 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SLC22A1O15245 554 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SPRY3O43610 288 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MAS1P04201 325 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 HCKP08631 526 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 DANCRP0C864 163 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PRF1P14222 555 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SRP9P49458 86 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 RBP2P50120 134 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PPOXP50336 477 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP1B3P54709 279 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 VBP1P61758 197 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG3P63215 75 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CTF1Q16619 201 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CEP78Q5JTW2 689 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM209AQ5JX71 171 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 USP43Q70EL4 1123 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8□□□□□ -1.13
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms