RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RHOBP62745 196 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CDK5R1Q15078 307 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CEBPEQ15744 281 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TAS1R1Q7RTX1 841 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CMBLQ96DG6 245 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 C12orf57Q99622 126 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OCEL1Q9H607 264 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR1A1Q9P1Q5 309 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 IGHV3-9P01782 118 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 IAPPP10997 89 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FUT3P21217 361 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 LIPAP38571 399 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GNG4P50150 75 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MICBQ29980 383 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DLK2Q6UY11 383 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 Q6ZNX1 250 aa6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM208Q9BTX3 173 aa6.04□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FAM3AP98173 230 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF528Q3MIS6 628 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR13H1Q8NG92 308 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZBP1Q9H171 429 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TSPAN12O95859 305 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PTHLHP12272 177 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM65Q6PI78 240 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ACY3Q96HD9 319 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR10C1Q96KK4 312 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GPR137Q96N19 417 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ANKRD10Q9NXR5 420 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ISL1P61371 349 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FUT7Q11130 342 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ETFDHQ16134 617 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 XKR7Q5GH72 579 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 OPRK1P41145 380 aa6.03□□□□□ -1.44
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USP46-201ENST00000441222 Q56UQ5 140 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 VWA2Q5GFL6 755 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 STUMQ69YW2 141 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR13G1Q8NGZ3 307 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR5R1Q8NH85 324 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MMP17Q9ULZ9 603 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TNFSF11O14788 317 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 KRASP01116 189 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR5AL1P0C617 328 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 PSMB2P49721 201 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 LYPD8Q6UX82 237 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BTLAQ7Z6A9 289 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NKAIN4Q8IVV8 208 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MAP6Q96JE9 813 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 A0A1B0GTQ1 180 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 A0A1W2PR48 441 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ATF1P18846 271 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SLC19A1P41440 591 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 NOVP48745 357 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 RAG2P55895 527 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 HFEQ30201 348 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 ANKRD53Q8N9V6 530 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 UBALD1Q8TB05 177 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MARCH1Q8TCQ1 289 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 SH2D2AQ9NP31 389 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 MANBALQ9NQG1 85 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.03□□□□□ -1.44
USP46-201ENST00000441222 BMPR1BO00238 502 aa6.02□□□□□ -1.45
USP46-201ENST00000441222 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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