RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 DUX4L4P0CJ87 422 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DUX4L5P0CJ88 424 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DUX4L6P0CJ89 424 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DUX4L7P0CJ90 424 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 TGM4P49221 684 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 POU4F2Q12837 409 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 GFOD2Q3B7J2 385 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35D3Q5M8T2 416 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 PLBD1Q6P4A8 553 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 C17orf107Q6ZR85 190 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 AQP12AQ8IXF9 295 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 C8orf46Q8TAG6 207 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 OR5P3Q8WZ94 311 aa17.29■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa17.29■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 TNFRSF19Q9NS68 423 aa17.29■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 DUX4Q9UBX2 424 aa17.29■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 CLPSL1A2RUU4 121 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 KCNAB3O43448 404 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 NDUFB3O43676 98 aa17.28■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 ACKR3P25106 362 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 IER3P46695 156 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 CDK5Q00535 292 aa17.28■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 GINS1Q14691 196 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 CMTM4Q8IZR5 234 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 PIP4P2Q8N4L2 257 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 FAM216BQ8N7L0 139 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 SCCPDHQ8NBX0 429 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 CITED1Q99966 193 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 BRD7Q9NPI1 651 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 HAO2Q9NYQ3 351 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 SELENOFO60613 162 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 AMY2BP19961 511 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 GUCA2AQ02747 115 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 LRRC10Q5BKY1 277 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 FGFRL1Q8N441 504 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC197Q8NCU1 140 aa17.27■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 CANT1Q8WVQ1 401 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 LRTOMTQ8WZ04 291 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 PKP2Q99959 881 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 DPAGT1Q9H3H5 408 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF556Q9HAH1 456 aa17.27■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP17.27■□□□□ 0.36
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LIMS1-208ENST00000428064 DCTDP32321 178 aa17.26■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF788Q6ZQV5 615 aa17.26■□□□□ 0.35
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LIMS1-208ENST00000428064 CLPTM1LQ96KA5 538 aa17.26■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 LYZL4Q96KX0 146 aa17.26■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 ONECUT1Q9UBC0 465 aa17.26■□□□□ 0.35
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LIMS1-208ENST00000428064 ANXA8P13928 327 aa17.25■□□□□ 0.35
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LIMS1-208ENST00000428064 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa17.25■□□□□ 0.35
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LIMS1-208ENST00000428064 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP17.25■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A19Q9HC21 320 aa17.25■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 ZNRD1Q9P1U0 126 aa17.25■□□□□ 0.35
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LIMS1-208ENST00000428064 FBP1P09467 338 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 CAV3P56539 151 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 IKZF1Q13422 519 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 Q8N7P7 452 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 ANGPTL6Q8NI99 470 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJC9Q8WXX5 260 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 PIGCQ92535 297 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 RNF170Q96K19 258 aa17.24■□□□□ 0.35
LIMS1-208ENST00000428064 GAFA1Q96PS6 74 aa17.24■□□□□ 0.35
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