RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIAL4EA0A075B759 164 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM210A6NLX4 147 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIAL4DF5H284 164 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 J3QLW9 94 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FSTL3O95633 263 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MSMBP08118 114 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIAL4FP0DN26 164 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAHP16930 419 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF19P17023 458 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCL1P22362 96 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF154Q13106 437 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCTD8Q6ZWB6 473 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KRT74Q7RTS7 529 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 WDR86Q86TI4 376 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYS1Q8N2H4 156 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRG4Q8WWG1 115 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5P3Q8WZ94 311 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LPAR2Q9HBW0 351 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM160Q9NX00 188 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ERVK13-1Q9NX77 482 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPIAL4AQ9Y536 164 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 V9GYS6 101 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.59□□□□□ -0.07
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 A0A1B0GTI1 187 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 H0YJX3 145 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYT7O43581 403 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF205O95201 554 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HTR1AP08908 422 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNAO1P09471 354 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PCMT1P22061 227 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP78Q5JTW2 689 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLCXD3Q63HM9 321 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EGFL6Q8IUX8 553 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC54Q8NEL0 328 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR2G2Q8NGZ5 317 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TFAP2CQ92754 450 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PELI1Q96FA3 418 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF170Q96K19 258 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 JAM3Q9BX67 310 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TANC2Q9HCD6 1990 aa14.58□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIVEP2P31629 2446 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEACAM18A8MTB9 384 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NRASP01111 189 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF12P17014 697 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DCKP27707 260 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 THBS2P35442 1172 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AQP4P55087 323 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CSNK2BP67870 215 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KCNJ8Q15842 424 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEACAM21Q3KPI0 293 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF404Q494X3 552 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM201AQ5SY85 155 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CLVS2Q5SYC1 327 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FDX2Q6P4F2 183 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 Q6ZSR3 168 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF826PQ6ZT77 177 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM186Q96B77 213 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRIM36Q9NQ86 728 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.57□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TRAV20A0A0B4J274 112 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OR5B21A6NL26 309 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDIPTO14735 213 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CRLF1O75462 422 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RPS2P15880 293 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYL12AP19105 171 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HNF1AP20823 631 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CPT2P23786 658 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KIR3DL2P43630 455 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPM6AP51674 278 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCR9P51686 369 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GNG3P63215 75 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MED21Q13503 144 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM244Q5VVB8 128 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MOB3CQ70IA8 216 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LRRC29Q8WV35 223 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TLNRD1Q9H1K6 362 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TMEM165Q9HC07 324 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HIF1ANQ9NWT6 349 aa14.56□□□□□ -0.08
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FRRS1LQ9P0K9 344 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.6 ms