RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ERGIC3Q9Y282 383 aa25.43■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 MYL12BO14950 172 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A16P16260 332 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 NR4A2P43354 598 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 GATA4P43694 442 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF676Q8N7Q3 588 aa25.42■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ACANP16112 2415 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 A0A096LNT2 108 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 H7C1Q1 480 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 WNT4P56705 351 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 IRF3Q14653 427 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 CDK5R1Q15078 307 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 MPPED2Q15777 294 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM42Q69YG0 159 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 MOGAT3Q86VF5 341 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC54Q8NEL0 328 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 OR51A4Q8NGJ6 313 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 OR5AK2Q8NH90 309 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 OR5P3Q8WZ94 311 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TMUB1Q9BVT8 246 aa25.41■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 CR1P17927 2039 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM212A6NML5 194 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ANXA2P2A6NMY6 339 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 OGG1O15527 345 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 RGS10O43665 173 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 PMELP40967 661 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 DMRTC1Q5HYR2 192 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 WDR86Q86TI4 376 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 HPSE2Q8WWQ2 592 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM36Q9NQ86 728 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM106BQ9NUM4 274 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 HHLA2Q9UM44 414 aa25.4■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 MT-ND2P03891 347 aa25.39■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 CEP78Q5JTW2 689 aa25.39■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 ABCB9Q9NP78 766 aa25.39■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 C14orf119Q9NWQ9 140 aa25.39■■□□□ 1.66
PKDCC-202ENST00000401498 PPIHO43447 177 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF12P17014 697 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 THBS2P35442 1172 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MZT1Q08AG7 82 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CLVS2Q5SYC1 327 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MND1Q9BWT6 205 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 UFSP2Q9NUQ7 469 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 BLOC1S6Q9UL45 172 aa25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZANQ9Y493 2812 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 NRASP01111 189 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 GRPP07492 148 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MOB3CQ70IA8 216 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 PRSS48Q7RTY5 328 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZFP41Q8N8Y5 198 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ERGIC1Q969X5 290 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MICU1Q9BPX6 476 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 COMMD4Q9H0A8 199 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 PLEKHA1Q9HB21 404 aa25.38■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CLDN25C9JDP6 229 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CDH15P55291 814 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CEACAM21Q3KPI0 293 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 OR1M1Q8NGA1 313 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM19Q96E16 107 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 RNF170Q96K19 258 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 RTL8AQ9BWD3 113 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC90BQ9GZT6 254 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 GPR173Q9NS66 373 aa25.37■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 F8P00451 2351 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 CD99P14209 185 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 C11orf53Q8IXP5 236 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 Q8TCH9 128 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 C10orf35Q96D05 121 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 COX4I2Q96KJ9 171 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 OR5M11Q96RB7 305 aa25.36■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 SLC3A1Q07837 685 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF154Q13106 437 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF181Q2M3W8 571 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 FAM76BQ5HYJ3 339 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 PLCXD3Q63HM9 321 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 FGGYQ96C11 551 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 FN3KRPQ9HA64 309 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 WIPI2Q9Y4P8 454 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 MED13LQ71F56 2210 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD61A6NGH8 418 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM178BH3BS89 294 aa25.35■■□□□ 1.65
PKDCC-202ENST00000401498 IFNL4K9M1U5 179 aa25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms