RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378357.8

CA9-201, Transcript of carbonic anhydrase 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CA9, Length 1,618 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9-201ENST00000378357 ACTC1P68032 377 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ACTA1P68133 377 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 FOXL1Q12952 345 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 TMEM246Q9BRR3 403 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 AASSQ9UDR5 926 aa14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 MAGEA13PA6NCF6 341 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ACOD1A6NK06 481 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 WBP4O75554 376 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 CLIC3O95833 236 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 SLC2A1P11166 492 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ATP6V1E1P36543 226 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 SRP9P49458 86 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ISL1P61371 349 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 IL5RAQ01344 420 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 ZNF404Q494X3 552 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 UPRTQ96BW1 309 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 RNFT2Q96EX2 444 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 RGCCQ9H4X1 137 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 VWFP04275 2813 aa14.65□□□□□ -0.06
CA9-201ENST00000378357 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 FSTL3O95633 263 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 PLATP00750 562 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 HLA-DPB1P04440 258 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 GATA4P43694 442 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF92Q03936 586 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 BAMBIQ13145 260 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 PRR31Q5SQ13 230 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF684Q5T5D7 378 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 PGAP1Q75T13 922 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SSX6Q7RTT6 188 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TFAP2CQ92754 450 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 FAM206AQ9NX38 181 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 C5orf63A6NC05 138 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SULT1C4O75897 302 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 APOL3O95236 402 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 CPT2P23786 658 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 AQP4P55087 323 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 RAB40BQ12829 278 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MAB21L1Q13394 359 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SLC9A3R2Q15599 337 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 OR10H4Q8NGA5 316 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 OR2AE1Q8NHA4 323 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 FBLIM1Q8WUP2 373 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 LGALS12Q96DT0 336 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 OR10A2Q9H208 303 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MOB1AQ9H8S9 216 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MIOXQ9UGB7 285 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 CLDN34H7C241 214 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 PSMD9O00233 223 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 GNB2P62879 340 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 FAM57BQ71RH2 274 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 Q8TCH9 128 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ITFG2Q969R8 447 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TBX5Q99593 518 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TMEM100Q9NV29 134 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF319Q9P2F9 582 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 SCOCQ9UIL1 159 aa14.63□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TGP01266 2768 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TRAV40A0A0B4J280 105 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 DPPA5A6NC42 116 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 TBX1O43435 398 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 KCNAB3O43448 404 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 IGHA1P01876 353 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 KRT8P05787 483 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 GNAO1P09471 354 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 CD200P41217 278 aa14.62□□□□□ -0.07
CA9-201ENST00000378357 ZNF85Q03923 595 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms