RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 JAGN1Q8N5M9 183 aa23.48■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR13G1Q8NGZ3 307 aa23.45■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa23.44■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM255AQ5JRV8 349 aa23.43■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF404Q494X3 552 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACBD4Q8NC06 268 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR5P3Q8WZ94 311 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITPKCQ96DU7 683 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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CTDNEP1-201ENST00000318988 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
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