RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 GABARAPO95166 117 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CSF3P09919 207 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 OCM2P0CE71 109 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A16P16260 332 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ERVS71-1P61550 626 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 INSL4Q14641 139 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ACSM3Q53FZ2 586 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A40Q8TBP6 338 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 OR14A2Q96R54 314 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 BATF3Q9NR55 127 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 DHDHQ9UQ10 334 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CMAHPQ9Y471 501 aa15.56■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZNF879B4DU55 563 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 AIREO43918 545 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RAC2P15153 192 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 GSK3AP49840 483 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RPS23P62266 143 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SPATA46Q5T0L3 261 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PGAP1Q75T13 922 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PHYHIPQ92561 330 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 DERL3Q96Q80 235 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 NDUFA13Q9P0J0 144 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SSR3Q9UNL2 185 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.55■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 H3BSH0 61 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CD5LO43866 347 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ACKR3P25106 362 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MAGEB1P43366 347 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SOX2P48431 317 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TMBIM6P55061 237 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CEACAM19Q7Z692 300 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TMEM106AQ96A25 262 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 C10orf35Q96D05 121 aa15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 A6NHS1 94 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 VWC2LB2RUY7 222 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PIN1P1O15428 100 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 LMX1BO60663 402 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CD2P06729 351 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 UCHL1P09936 223 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZNF250P15622 560 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 DDOSTP39656 456 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MAP2K3P46734 347 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 EVX1P49640 407 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PDLIM4P50479 330 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CTF1Q16619 201 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 TMEM249Q2WGJ8 235 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZNF718Q3SXZ3 478 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ZBTB37Q5TC79 503 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 KRT74Q7RTS7 529 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RAB2BQ8WUD1 216 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 HAVCR1Q96D42 359 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CMBLQ96DG6 245 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 BCL7BQ9BQE9 202 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RAB1BQ9H0U4 201 aa15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CD300LBA8K4G0 201 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 MPV17P39210 176 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PRSS12P56730 875 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PSG7Q13046 419 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 C22orf42Q6IC83 251 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 LRP11Q86VZ4 500 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 CENPOQ9BU64 300 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 PLEKHA1Q9HB21 404 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 NOX4Q9NPH5 578 aa15.52■□□□□ 0.08
PTX4-201ENST00000293922 GGT3PA6NGU5 568 aa15.51■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 NDUFS8O00217 210 aa15.51■□□□□ 0.07
PTX4-201ENST00000293922 ARL6IP5O75915 188 aa15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms