RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000185355.6

Ldb1-208, Transcript of LIM domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ldb1, Length 2,088 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zbtb32Q9JKD9 465 aa24.76■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Wscd2D4PHA7 571 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm8220F6YKI2 213 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fbxw25F7C9P2 466 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Bet1O35623 118 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Upk2P38575 184 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Shc1P98083 579 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AmbpQ07456 349 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1126Q7TR49 314 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 TxnipQ8BG60 397 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Oxa1lQ8BGA9 433 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Eif1axQ8BMJ3 144 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn1r21Q8R2C6 297 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Thap7Q8VCZ3 309 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 NubplQ9CWD8 319 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Defb5Q9EPV9 64 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tsc22d3Q9Z2S7 137 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AspmQ8CJ27 3122 aa24.75■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Vmn2r107E9PZJ7 861 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lire1P11260 357 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Bmi1P25916 324 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 GdnfP48540 211 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hmga2P52927 108 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 ActbP60710 375 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Actg1P63260 375 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ccdc190Q3URK1 288 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr5Q60889 312 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp747Q8BHM7 422 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Smim37Q8BT35 56 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Kiaa0513Q8R0A7 407 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Asf1bQ9DAP7 202 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp108E9Q8I5 642 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Guca2aP33680 116 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Macrod2Q3UYG8 475 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 SordQ64442 357 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Otop1Q80VM9 600 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Armcx6Q8K3A6 301 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1351Q8VGU6 319 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Klf7Q99JB0 301 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AspdhQ9DCQ2 287 aa24.74■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 DytnA2CI98 653 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Aldh3b2E9Q3E1 479 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lmx1bO88609 395 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Prss48Q14B25 312 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr107Q7TRK4 309 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 BtlaQ7TSA3 306 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mob1aQ921Y0 216 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 AplfQ9D842 499 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 GmfgQ9ERL7 142 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Znf551B2RUI1 696 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Agtr1aP29754 359 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Defb21Q8C5Z4 100 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1090Q8VGA6 313 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr642Q924X8 314 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sec61a2Q9JLR1 476 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Adam11Q9R1V4 773 aa24.73■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 A26c2A0A140LHE4 291 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm21411J3KMS0 136 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Cbfa2t3O54972 620 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Atp5j2P56135 88 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ikzf2P81183 526 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Treml4Q3LRV9 263 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Jsrp1Q3MI48 332 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ceacam19Q3TQ88 271 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Negr1Q80Z24 348 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tctn3Q8R2Q6 595 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1110Q8VG38 312 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tram1Q91V04 374 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Hyal1Q91ZJ9 462 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ogfod3Q9D136 315 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Col5a1O88207 1838 aa24.72■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fbxw27A0A1D5RLF0 466 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr1066A2AK62 313 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Stc2O88452 296 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ear2P97425 156 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr733Q14AK5 308 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Arhgap9Q1HDU4 648 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ferd3lQ923Z4 168 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tnk1Q99ML2 666 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lap3Q9CPY7 519 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 1700034E13RikQ9D2T6 108 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 FtmtQ9D5H4 237 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Psma6Q9QUM9 246 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sirpb1bA0A0A6YXN8 397 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Olfr65A0A1B0GSF4 315 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 4930402F06RikA2AUQ8 332 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Gm21560D3Z7A4 205 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Zfp988F6VKC7 633 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Sirpb1cK7N6K7 397 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 4930555G01RikL7N253 205 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Rab6aP35279 208 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Ext1P97464 746 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 CstbQ62426 98 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Tas2r136Q7TQA8 305 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Dhrs7cQ8CHS7 311 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Mitd1Q8VDV8 249 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Lnx2Q91XL2 687 aa24.71■■□□□ 1.55
Ldb1-208ENSMUST00000185355 Fam3bQ9D309 235 aa24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms