RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 DCXRQ7Z4W1 244 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RORBQ92753 470 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB18Q9NP72 206 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF391Q9UJN7 358 aa22.34■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFB7P17568 137 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 GSK3BP49841 420 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf46Q8TAG6 207 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 C17orf50Q8WW18 174 aa22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
CAPNS1-217ENST00000629983 NME4O00746 187 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CDIPTO14735 213 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TIPRLO75663 272 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SPARCP09486 303 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GNALP38405 381 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TGM4P49221 684 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TIGD6Q17RP2 521 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 STUMQ69YW2 141 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ15Q99712 375 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 HAO2Q9NYQ3 351 aa22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R1W7 72 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPTL7O43827 346 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 IDH3BO43837 385 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO24O75426 580 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 TFF1P04155 84 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 AMY2BP19961 511 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SPIBQ01892 262 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 LYPD4Q6UWN0 246 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC16A9Q7RTY1 509 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CYB561A3Q8NBI2 242 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51L1Q8NGJ5 315 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 R3HDM4Q96D70 268 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SLAMF6Q96DU3 332 aa22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PLXNB1O43157 2135 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YAE9 185 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GFOD2Q3B7J2 385 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2T4Q8NH00 348 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PHF21AQ96BD5 680 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MED30Q96HR3 178 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MICU1Q9BPX6 476 aa22.3■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GADD45GO95257 159 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PSKH1P11801 424 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM11AP58511 58 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM3AP98173 230 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZBTB37Q5TC79 503 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CPLX4Q7Z7G2 160 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SPSB4Q96A44 273 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 REEP6Q96HR9 211 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS1Q96LJ7 313 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 GAFA1Q96PS6 74 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 WDR13Q9H1Z4 485 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP28Q9H239 520 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 V9GYQ6 96 aa22.29■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ANXA2P2A6NMY6 339 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF878C9JN71 531 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PAX6P26367 422 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 CX3CR1P49238 355 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DGUOKQ16854 277 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DTX3Q8N9I9 347 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf34Q96L11 122 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FUZQ9BT04 418 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 KCTD8Q6ZWB6 473 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM185AQ8N0U4 392 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4F17Q8NGA8 305 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5D13Q8NGL4 314 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4F4Q96R69 305 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 RTL8AQ9BWD3 113 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CAPNS1-217ENST00000629983 NOTCH3Q9UM47 2321 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CD28P10747 220 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD11B1P28845 292 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 IFNGR2P38484 337 aa22.26■■□□□ 1.15
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