RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 CYSLTR2Q9NS75 346 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ETV7Q9Y603 341 aa21.45■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 GMDSO60547 372 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 APOA1P02647 267 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM157BP0CG42 384 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CD40LGP29965 261 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CHRNB4P30926 498 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1CBP62140 327 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ADORA2A-AS1P86434 159 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RY14Q15391 338 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 OR56B2PQ8NGI1 322 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 CNTD2Q9H8S5 307 aa21.44■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR173Q9NS66 373 aa21.44■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM25CB3EWG5 89 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM25GB3EWG6 89 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW12Q6X9E4 464 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF144BQ7Z419 303 aa21.43■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OR51D1Q8NGF3 324 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 UBASH3BQ8TF42 649 aa21.43■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 FABP12A6NFH5 140 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 GGT3PA6NGU5 568 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 NRASP01111 189 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CALCRP30988 508 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ASCL1P50553 236 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 NAAAQ02083 359 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf76Q3KRA6 126 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 DMRTC1Q5HYR2 192 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CRIP3Q6Q6R5 217 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 SPACA5Q96QH8 159 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 COQ3Q9NZJ6 369 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 KCNN3Q9UGI6 736 aa21.42■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 M0R1B8 84 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 RAD52P43351 418 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 RIN1Q13671 783 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF79Q15937 498 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 SPATA46Q5T0L3 261 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa21.41■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A38Q96DW6 304 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC120Q96HB5 630 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 EXTL2Q9UBQ6 330 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO7BQ6PIF6 2116 aa21.41■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa21.4■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 CST4P01036 141 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 TUBG1P23258 451 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 POU3F4P49335 361 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ERVS71-1P61550 626 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 KISS1Q15726 138 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 SSX8Q7RTT4 187 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A40Q8TBP6 338 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 NPRL2Q8WTW4 380 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGCQ92535 297 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 TECTBQ96PL2 329 aa21.4■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCG5Q9H222 651 aa21.4■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 TUBG2Q9NRH3 451 aa21.4■■□□□ 1.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 ALKBH2Q6NS38 261 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM4Q8IZR5 234 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT11Q8NCW6 608 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4M1Q8NGD0 313 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 LILRB4Q8NHJ6 448 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 BCL2L14Q9BZR8 327 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PALMDQ9NP74 551 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR14LQ5THK1 2151 aa21.39■■□□□ 1.02
CAPNS1-215ENST00000628018 PRKACBP22694 351 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 CAPZA1P52907 286 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 C1orf174Q8IYL3 243 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 FTMTQ8N4E7 242 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 CMBLQ96DG6 245 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 NEK6Q9HC98 313 aa21.39■■□□□ 1.01
CAPNS1-215ENST00000628018 CRIM1Q9NZV1 1036 aa21.39■■□□□ 1.01
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