RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598256.1

LTBP4-222, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, human

TSL 2

Gene LTBP4, Length 752 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LTBP4-222	ENST00000598256	TMEM106A	Q96A25	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	C14orf79	Q96F83	325 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	STUB1	Q9UNE7	303 aa		13.62	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PLCE1	Q9P212	2302 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		A6NIN4	97 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF879	B4DU55	563 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GABRP	O00591	440 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PRF1	P14222	555 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TTK	P33981	857 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GNAL	P38405	381 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MAGEB1	P43366	347 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FABP5	Q01469	135 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	INSL4	Q14641	139 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	EFNB3	Q15768	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		Q6ZSR3	168 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PIGC	Q92535	297 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	YIPF6	Q96EC8	236 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SSR3	Q9UNL2	185 aa		13.61	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	HIVEP1	P15822	2718 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		B9A039	149 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		M0R233	179 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	LILRA1	O75019	489 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GADD45A	P24522	165 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	EVX1	P49640	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SNRPD2	P62316	118 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ARFGEF3	Q5TH69	2177 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	AGAP6	Q5VW22	663 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PAMR1	Q6UXH9	720 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SATL1	Q86VE3	508 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF611	Q8N823	705 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FGGY	Q96C11	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DERL3	Q96Q80	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.6	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CHD3	Q12873	2000 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256		A0A1W2PPK0	400 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SC5D	O75845	299 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CA6	P23280	308 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SSTR2	P30874	369 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ALDH3B1	P43353	468 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PRDX4	Q13162	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	BLMH	Q13867	455 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	PIGT	Q969N2	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	MSL2	Q9HCI7	577 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	NOX4	Q9NPH5	578 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	NF1	P21359	2839 aa		13.59	□□□□□ -0.23
LTBP4-222	ENST00000598256	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	AIRE	O43918	545 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ARL6IP5	O75915	188 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CST4	P01036	141 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	NRAS	P01111	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	GAL	P22466	123 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	ZNF81	P51508	661 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	PPP3R1	P63098	170 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	OR8G1	Q15617	311 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	CEP78	Q5JTW2	689 aa		13.58	□□□□□ -0.24
LTBP4-222	ENST00000598256	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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