RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 UBE2J2Q8N2K1 259 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR1J1Q8NGS3 322 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM239Q8WW34 195 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM186Q96B77 213 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 C7orf34Q96L11 122 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 EPYCQ99645 322 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 THTPAQ9BU02 230 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 C11orf98E9PRG8 122 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 GPR171O14626 319 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 OR2T1O43869 369 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 SLC34A1Q06495 639 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 C9orf135Q5VTT2 229 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa6.48□□□□□ -1.37
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ATG4D-210ENST00000588972 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 BEX5Q5H9J7 111 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FGD3Q5JSP0 725 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 CARD17Q5XLA6 110 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 LCN8Q6JVE9 175 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 ASRGL1Q7L266 308 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
ATG4D-210ENST00000588972 AAED1Q7RTV5 226 aa6.48□□□□□ -1.37
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