RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 ASF1BQ9NVP2 202 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CKLFQ9UBR5 152 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 H7C417 338 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCSO14618 274 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 FARS2O95363 451 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CD1AP06126 327 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CD2P06729 351 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CNR1P21554 472 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 RPS18P62269 152 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 TEX30Q5JUR7 227 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.35□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 PHYHIPQ92561 330 aa13.35□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 SLC17A2O00624 439 aa13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 AP3S2P59780 193 aa13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 RASL10BQ96S79 203 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-205ENST00000587860 KCNK17Q96T54 332 aa13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 B9A039 149 aa13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-205ENST00000587860 TTRP02766 147 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 OR2B8PP59922 312 aa13.33□□□□□ -0.28
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CTIF-205ENST00000587860 TCEAL6Q6IPX3 200 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 DTX1Q86Y01 620 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 SAP25Q8TEE9 199 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 DDIT4LQ96D03 193 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 POFUT1Q9H488 388 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 SYT7O43581 403 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 ROM1Q03395 351 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 PMPCAQ10713 525 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 NR0B2Q15466 257 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-205ENST00000587860 TAF13Q15543 124 aa13.32□□□□□ -0.28
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