RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 TSPOAP1O95153 1857 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.98
PTPRM-204ENST00000577468 ARAP3Q8WWN8 1544 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0B4J2E0 115 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GX12 115 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM74A7A6NL05 159 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DHRS7CA6NNS2 312 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf100A8MU93 164 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 A8MVM7 634 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 G3V4G9 280 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 M0QZQ0 153 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DEGS1O15121 323 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZG16O60844 167 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DIRAS1O95057 198 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 P04436 131 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ALPLP05186 524 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CRYBA1P05813 215 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CSN3P07498 182 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NGFRP08138 427 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UCHL1P09936 223 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UBBP0CG47 229 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LIMS3P0CW19 117 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 LIMS4P0CW20 117 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CD79AP11912 226 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 UNGP13051 313 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF17P17021 662 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 IL1RNP18510 177 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRKACGP22612 351 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 AADACP22760 399 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRPH2P23942 346 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HRH2P25021 359 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MPZP25189 248 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 NMBRP28336 390 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GRPRP30550 384 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 BRS3P32247 399 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 APLNRP35414 380 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 BDKRB1P46663 353 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RPL21P46778 160 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CRISP1P54107 249 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN20P56880 219 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ERVFC1-1P60608 527 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RAB8AP61006 207 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RHOBP62745 196 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SELENOWP63302 87 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP1BP68106 108 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35B1P78383 322 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CDK3Q00526 305 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ID2Q02363 134 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MXD1Q05195 221 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF763Q0D2J5 394 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MFAP5Q13361 173 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5I1Q13606 314 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR2F1Q13607 317 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CDH18Q13634 790 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HTR4Q13639 388 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF235Q14590 738 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 EBPQ15125 230 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 RHEBQ15382 184 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZSWIM7Q19AV6 140 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FAM74A3Q4VXF1 159 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PYY3Q5JQD4 70 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR10J3Q5JRS4 329 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM69Q5SWH9 247 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 C6orf141Q5SZD1 244 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR4A47Q6IF82 309 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD12Q6NUT3 480 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 WDR59Q6PJI9 974 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 ENPP6Q6UWR7 440 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 WDR82Q6UXN9 313 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 GSG1LQ6UXU4 331 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 FRRS1Q6ZNA5 592 aa2.65□□□□□ -1.99
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PTPRM-204ENST00000577468 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 PRSS45Q7RTY3 260 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TMPRSS12Q86WS5 348 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TDHQ8IZJ6 230 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 SPEM1Q8N4L4 309 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF676Q8N7Q3 588 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 CHST4Q8NCG5 386 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 TSTD1Q8NFU3 115 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-204ENST00000577468 OR5M9Q8NGP3 310 aa2.65□□□□□ -1.99
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