RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561514.1

PALB2-202, Transcript of partner and localizer of BRCA2, humanhuman

TSL 5

Gene PALB2, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2-202ENST00000561514 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ST8SIA4Q92187 359 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SAMD8Q96LT4 415 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 GPA33Q99795 319 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MMP26Q9NRE1 261 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 COA4Q9NYJ1 87 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ABCD2Q9UBJ2 740 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 DUX4Q9UBX2 424 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 VWFP04275 2813 aa7.07□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TRAPPC2LH3BP13 241 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CCNB2O95067 398 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 LAP3P28838 519 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SLC6A9P48067 706 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TAS2R41P59536 307 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ERVK-25P63136 954 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PAX8Q06710 450 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 KLF10Q13118 480 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NFYCQ13952 458 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ATP6AP1Q15904 470 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CTF1Q16619 201 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ALG10Q5BKT4 473 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TTC23Q5W5X9 447 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ZNF774Q6NX45 483 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 Q6ZR03 302 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PGAP1Q75T13 922 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ST7LQ8TDW4 575 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 C4orf45Q96LM5 186 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NUAK2Q9H093 628 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SLITRK2Q9H156 845 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 OR51M1Q9H341 326 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 POLE4Q9NR33 117 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MCUBQ9NWR8 336 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CMTM6Q9NX76 183 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ZNF69Q9UC07 566 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CD300AQ9UGN4 299 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 IL19Q9UHD0 177 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 A4GNTQ9UNA3 340 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MED31Q9Y3C7 131 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 DMRT1Q9Y5R6 373 aa7.06□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 OR6C6A6NF89 314 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 A6NIZ1 184 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MPTX1A8MV57 137 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 H7C2Y5 167 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 IFNL4K9M1U5 179 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PIP5K1CO60331 668 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 PLATP00750 562 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SCG5P05408 212 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SELLP14151 372 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF1AP19438 455 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 TNFRSF1BP20333 461 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 GSTM3P21266 225 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MSR1P21757 451 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CCNOP22674 350 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 FASP25445 335 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 MDH2P40926 338 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SLC15A1P46059 708 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 NUDT2P50583 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SPCS3P61009 180 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RAP1BP61224 184 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 BTG1P62324 171 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RAP1AP62834 184 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 IL13RA1P78552 427 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 CD47Q08722 323 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 LAPTM4AQ15012 233 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ZMYND11Q15326 602 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SGCAQ16586 387 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 RABL3Q5HYI8 236 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 XAF1Q6GPH4 301 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.05□□□□□ -1.28
PALB2-202ENST00000561514 ARL9Q6T311 187 aa7.05□□□□□ -1.28
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