RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560971.1

GCSHP2-201, Transcript of glycine cleavage system protein H pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene GCSHP2, Length 527 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIAL4EA0A075B759 164 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIAL4DF5H284 164 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TTRP02766 147 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 KRT8P05787 483 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIAL4FP0DN26 164 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 LCN2P80188 198 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF85Q03923 595 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PRDX4Q13162 271 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PLPP7Q8NBV4 271 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PIGCQ92535 297 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 RNF7Q9UBF6 113 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.6■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TRAV20A0A0B4J274 112 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL15A6NJ78 407 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 A6NLC8 198 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CEACAM18A8MTB9 384 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC16A6O15403 523 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 CST4P01036 141 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 IGLV3-1P01715 115 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 MZT1Q08AG7 82 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 C11orf53Q8IXP5 236 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FTMTQ8N4E7 242 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 DEFB108BQ8NET1 73 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 RHOXF1Q8NHV9 184 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 ITPKCQ96DU7 683 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FAHD2AQ96GK7 314 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 TMEM246Q9BRR3 403 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 SLC22A13Q9Y226 551 aa15.59■□□□□ 0.09
GCSHP2-201ENST00000560971 F5H0A9 414 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 J3QRE1 110 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 FAM157CP0CG43 387 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 HNF1AP20823 631 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PEX2P28328 305 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CD80P33681 288 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MAP2K3P46734 347 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 CSNK2BP67870 215 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SNCBQ16143 134 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF404Q494X3 552 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 TP53I3Q53FA7 332 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 LIPNQ5VXI9 398 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 OR1M1Q8NGA1 313 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 OR5P3Q8WZ94 311 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MPC1Q9Y5U8 109 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SNX5Q9Y5X3 404 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MXRA5Q9NR99 2828 aa15.58■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ANXA2P2A6NMY6 339 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 P2RY10O00398 339 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SULT1C4O75897 302 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 WNT2P09544 360 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SRD5A1P18405 259 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 THBS2P35442 1172 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 IL5RAQ01344 420 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF91Q05481 1191 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF154Q13106 437 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ODF4Q2M2E3 257 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DMRTC1Q5HYR2 192 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 LYPD2Q6UXB3 125 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF555Q8NEP9 628 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 HPSE2Q8WWQ2 592 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RORBQ92753 470 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 LGALS12Q96DT0 336 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 RDH12Q96NR8 316 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MICU1Q9BPX6 476 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 AMBNQ9NP70 447 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 GNG8Q9UK08 70 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 A0A1B0GTI1 187 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 SNTNA6NMZ2 147 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 C3orf80F5H4A9 247 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 MPZL2O60487 215 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 FSTL3O95633 263 aa15.56■□□□□ 0.08
GCSHP2-201ENST00000560971 DBTP11182 482 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.3 ms