RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	PRKX	P51817	358 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CAPZA1	P52907	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CDH15	P55291	814 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1CB	P62140	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TUBA1B	P68363	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TLE4	Q04727	773 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	WDR38	Q5JTN6	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CDH24	Q86UP0	819 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PHC2	Q8IXK0	858 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SPERT	Q8NA61	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	LINC01560	Q8TB33	94 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	HTRA1	Q92743	480 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GHSR	Q92847	366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PIGT	Q969N2	578 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	FBXW5	Q969U6	566 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	HAVCR1	Q96D42	359 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	REEP6	Q96HR9	211 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OPALIN	Q96PE5	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OR5M11	Q96RB7	305 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	POU2F3	Q9UKI9	436 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	DHDH	Q9UQ10	334 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CMAHP	Q9Y471	501 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965		V9GYS6	101 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PLSCR5	A0PG75	271 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SHISA9	B4DS77	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OVOL3	O00110	214 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PSMD9	O00233	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TBX1	O43435	398 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GMDS	O60547	372 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	GPX5	O75715	221 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PNP	P00491	289 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	CST4	P01036	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TFAP2A	P05549	437 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	LCK	P06239	509 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ADH4	P08319	380 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	ADRA2A	P08913	450 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	OCM2	P0CE71	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	LOX	P28300	417 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	THBS4	P35443	961 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	TMBIM6	P55061	237 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	FAM3A	P98173	230 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	HGFAC	Q04756	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	BLMH	Q13867	455 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	NEDD8	Q15843	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CHP1-208	ENST00000560965	AGAP6	Q5VW22	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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