RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556374.5

ATXN3-241, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 1,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-241ENST00000556374 ZPLD1Q8TCW7 415 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ELP5Q8TE02 316 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 RNF128Q8TEB7 428 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DUSP19Q8WTR2 217 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PATE1Q8WXA2 126 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MVB12AQ96EY5 273 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZDHHC12Q96GR4 267 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CXorf58Q96LI9 332 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MOGAT1Q96PD6 335 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TGM7Q96PF1 710 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SCGB3A2Q96PL1 93 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 OR2A7Q96R45 310 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DMRTA2Q96SC8 542 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PHB2Q99623 299 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GFI1Q99684 422 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GPR174Q9BXC1 333 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TWSG1Q9GZX9 223 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CDCP1Q9H5V8 836 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PRORYQ9H606 182 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 UCK1Q9HA47 277 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ELOVL3Q9HB03 270 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MBD2Q9UBB5 411 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TUBD1Q9UJT1 453 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DTX4Q9Y2E6 619 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 R4GMQ9 66 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TRPM6Q9BX84 2022 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa3.9□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SCN2AQ99250 2005 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PRSS37A4D1T9 235 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 A8MUA0 341 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FAM25EA8MYX2 175 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 F5H697 171 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 H0YC42 278 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 H3BSH0 61 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TEX46H3BTG2 121 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF208O43345 1280 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ICOSLGO75144 302 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CFDP00746 253 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 IGHMP01871 453 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BGLAPP02818 100 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CD3DP04234 171 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CSN2P05814 226 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CHRM2P08172 466 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NMBP08949 121 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 OR4E1P0C645 316 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GIMD1P0DJR0 217 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NR2C1P13056 603 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TPT1P13693 172 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CTRB1P17538 263 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ADRA2CP18825 462 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 HSD11B1P28845 292 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CD1CP29017 333 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BDKRB2P30411 391 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 KIR3DL2P43630 455 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC26A5P58743 744 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 PPP1CAP62136 330 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 DEFA5Q01523 94 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MC2RQ01718 297 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF117Q03924 483 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 BTN1A1Q13410 526 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf61Q13536 156 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 FHL1Q13642 323 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ERV3-1Q14264 604 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SMCO1Q147U7 214 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TAF13Q15543 124 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CD226Q15762 336 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C2orf76Q3KRA6 126 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SMUG1Q53HV7 270 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM255AQ5JRV8 349 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 MORN5Q5VZ52 161 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 CTRB2Q6GPI1 263 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM225Q6GV28 225 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 TMEM81Q6P7N7 255 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 UQCC3Q6UW78 93 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC35D2Q76EJ3 337 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.89□□□□□ -1.79
ATXN3-241ENST00000556374 GRINAQ7Z429 371 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms