RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IGHG1P01857 330 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FABP2P12104 132 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GABRB1P18505 474 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 FUT1P19526 365 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CPOXP36551 454 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R31P59538 309 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DHODHQ02127 395 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 LDLRAD3Q86YD5 345 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LAX1Q8IWV1 398 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CDCP1Q9H5V8 836 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP64Q9NPA5 681 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 G6PC2Q9NQR9 355 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 B3GAT1Q9P2W7 334 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RHCGQ9UBD6 479 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 TRPM7Q96QT4 1865 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HMSDA8MTL9 139 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 S1PR2O95136 353 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 A8MXK9 166 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 G3V3Y1 287 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR51T1Q8NGJ9 327 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF480Q8WV37 535 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10A2Q9H208 303 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DECR2Q9NUI1 292 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HAO2Q9NYQ3 351 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 PTH2RP49190 550 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 AAED1Q7RTV5 226 aa5.69□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 NUDT8Q8WV74 236 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ESAMQ96AP7 390 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SLC30A3Q99726 388 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HSD17B6O14756 317 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 LATO43561 262 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-HP01893 362 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CISD3P0C7P0 127 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 DUSP1P28562 367 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GSK3BP49841 420 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 TBPL2Q6SJ96 375 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 AMBNQ9NP70 447 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-210ENST00000551525 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 GPX5O75715 221 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 ITGA5P08648 1049 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CD79AP11912 226 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CD96P40200 585 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CCR2P41597 374 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 CRISP1P54107 249 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRB-210ENST00000551525 RAG2P55895 527 aa5.68□□□□□ -1.5
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