RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 KIAA0040Q15053 153 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM128Q5BJH2 165 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 DBX2Q6ZNG2 339 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 PTP4A1Q93096 173 aa7.62□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
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PTPRB-208ENST00000550358 EXTL1Q92935 676 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 DVL1O14640 695 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 BCL2L11O43521 198 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
PTPRB-208ENST00000550358 MAGEB1P43366 347 aa7.61□□□□□ -1.19
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