RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 Q6ZR03 302 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 NDNFQ8TB73 568 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 HAVCR1Q96D42 359 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SYT3Q9BQG1 590 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SP140LQ9H930 580 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 CA10Q9NS85 328 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 GPR160Q9UJ42 338 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ZNF391Q9UJN7 358 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 SSR3Q9UNL2 185 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 ABCA4P78363 2273 aa6.97□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
CS-216ENST00000549221 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 A0A0G2JK05 382 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GGT3PA6NGU5 568 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 DHRS7CA6NNS2 312 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 IQCF6A8MYZ5 107 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 NCR1O76036 304 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 FSTP19883 344 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 KITLGP21583 273 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GALP22466 123 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CFL1P23528 166 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CALRP27797 417 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SDC2P34741 201 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 DDOSTP39656 456 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 PEX19P40855 299 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MAP2K3P46734 347 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 TMBIM6P55061 237 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CAV3P56539 151 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 OR10A3P58181 314 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 UBE2V2Q15819 145 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CEP78Q5JTW2 689 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 KRT74Q7RTS7 529 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SPOCK3Q9BQ16 436 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CHST5Q9GZS9 411 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 OPA3Q9H6K4 179 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GPR173Q9NS66 373 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 POU2F3Q9UKI9 436 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.96□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 F8P00451 2351 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PPW3 197 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 FAM221AA4D161 298 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CCDC160A6NGH7 325 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 TRIM64BA6NI03 449 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 A6NNC1 897 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 H0YL77 283 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MLNRO43193 412 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GMDSO60547 372 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CDRT1O95170 752 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SERPINA3P01011 423 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 IGHV3-13P01766 116 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 OR4A8P0C604 315 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF20P17024 532 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SRMP19623 302 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CA6P23280 308 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 GNALP38405 381 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 SERPINB10P48595 397 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MMP15P51511 669 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MXD1Q05195 221 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 PRDX4Q13162 271 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 MST1LQ2TV78 715 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 LYPD6Q86Y78 171 aa6.95□□□□□ -1.3
CS-216ENST00000549221 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms