RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545308.5

SNHG1-222, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, human

TSL 2

Gene SNHG1, Length 646 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG1-222	ENST00000545308	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SDHAF4	Q5VUM1	108 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TMEM135	Q86UB9	458 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GPD1L	Q8N335	351 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ARHGAP18	Q8N392	663 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DCUN1D4	Q92564	292 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MED10	Q9BTT4	135 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NTN4	Q9HB63	628 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DDX19A	Q9NUU7	478 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IL37	Q9NZH6	218 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		2.89	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A1B0GW55	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM92A	A1XBS5	289 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS37	A4D1T9	235 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		A8MUA0	341 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		M0R3G1	203 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	FAM189A1	O60320	539 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TNFSF13	O75888	250 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MMP23A	O75900	390 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IGHV4-34	P06331	123 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ZDHHC11B	P0C7U3	371 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GKN3P	P0CG01	181 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ICAM2	P13598	275 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MSR1	P21757	451 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OR1E1	P30953	314 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ACOT2	P49753	483 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TNNC1	P63316	161 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GTF2B	Q00403	316 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP6	Q13520	282 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GGTLC2	Q14390	218 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	HERPUD1	Q15011	391 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TRAM2	Q15035	370 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CST6	Q15828	149 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PAGE3	Q5JUK9	113 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	STUM	Q69YW2	141 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	TTC23L	Q6PF05	361 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		Q6ZR54	194 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SLC25A45	Q8N413	288 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NUBPL	Q8TB37	319 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	UCN3	Q969E3	161 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ECHDC3	Q96DC8	303 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PKMYT1	Q99640	499 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OR11A1	Q9GZK7	315 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PARVG	Q9HBI0	331 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DMAP1	Q9NPF5	467 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DUX4	Q9UBX2	424 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ZFHX3	Q15911	3703 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	APC	P25054	2843 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		A0A0G2JN53	185 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF233	A6NK53	670 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		E7ENQ6	273 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308		H0YHG0	523 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	BCKDK	O14874	412 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SCAMP2	O15127	329 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	AQP9	O43315	295 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	DPM1	O60762	260 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	NPIPB7	O75200	414 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	UTS2	O95399	124 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	MOS	P00540	346 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	OXT	P01178	125 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	IFNW1	P05000	195 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	SERPINB5	P36952	375 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SNHG1-222	ENST00000545308	CCR8	P51685	355 aa		2.87	□□□□□ -1.95

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