RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541990.5

THBS3-211, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 2,928 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-211ENST00000541990 NICN1Q9BSH3 213 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 VN1R1Q9GZP7 353 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SLC17A5Q9NRA2 495 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 LANCL2Q9NS86 450 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 AMDHD2Q9Y303 409 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SPACA6W5XKT8 324 aa8.1□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 HTR3BO95264 441 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 IGHV2-5P01817 119 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 ZNF141Q15928 474 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 ANKRD55Q3KP44 614 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SLC23A3Q6PIS1 610 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 TAAR8Q969N4 342 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 KIRREL1Q96J84 757 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 ZNF285Q96NJ3 590 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SPACA5Q96QH8 159 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 PRRT1Q99946 306 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SMIM3Q9BZL3 60 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 LYRM4Q9HD34 91 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PPE2 198 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 CT45A8P0DMV1 189 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 CT45A9P0DMV2 189 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 CT45A2Q5DJT8 189 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 DMRTC1Q5HYR2 192 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 ADAM5Q6NVV9 412 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 BCORP1Q8N888 145 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 DUSP23Q9BVJ7 150 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 SLC5A7Q9GZV3 580 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 CNTD2Q9H8S5 307 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 EMC9Q9Y3B6 208 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 LRP12Q9Y561 859 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.09□□□□□ -1.11
THBS3-211ENST00000541990 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 YIF1AO95070 293 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 F10P00742 488 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RNF224P0DH78 156 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CTLA4P16410 223 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 S100A10P60903 97 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 NAAAQ02083 359 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SKP2Q13309 424 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CLINT1Q14677 625 aa8.09□□□□□ -1.12
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THBS3-211ENST00000541990 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PARD6AQ9NPB6 346 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 POLE3Q9NRF9 147 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa8.09□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 C7orf77A4D0Y5 90 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 IFITM10A6NMD0 228 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CLDN4O14493 209 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SLC16A7O60669 478 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FREM3P0C091 2139 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 PRF1P14222 555 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 GPR3P46089 330 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FHITP49789 147 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 MEF2DQ14814 521 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZDHHC22Q8N966 263 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 OR52N4Q8NGI2 321 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 OR13C3Q8NGS6 347 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 RHOVQ96L33 236 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 OR10A5Q9H207 317 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 GSKIPQ9P0R6 139 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 SPTBN4Q9H254 2564 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 A0A1B0GV50 99 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 P2RY10O00398 339 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 CER1O95813 267 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FBP1P09467 338 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 S100PP25815 95 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 DNASE1L1P49184 302 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 FAM76BQ5HYJ3 339 aa8.08□□□□□ -1.12
THBS3-211ENST00000541990 TEX30Q5JUR7 227 aa8.08□□□□□ -1.12
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