RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522394.1

RRM2B-209, Transcript of ribonucleotide reductase regulatory TP53 inducible subunit M2B, human

TSL 2

Gene RRM2B, Length 389 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRM2B-209	ENST00000522394	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	IGKV3D-15	A0A087WSY6	115 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	C15orf61	A6NNL5	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PFDN6	O15212	129 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PRB4	P10163	310 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	CBR1	P16152	277 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	GRIA1	P42261	906 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	GNB1	P62873	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF763	Q0D2J5	394 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	COX10	Q12887	443 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PDK3	Q15120	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	LY6E	Q16553	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PARP6	Q2NL67	630 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	CASP12	Q6UXS9	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	OR6S1	Q8NH40	331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	GPR21	Q99679	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	KLHDC3	Q9BQ90	382 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	WDR41	Q9HAD4	459 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	MAT2B	Q9NZL9	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	MIOX	Q9UGB7	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	PPP1R3C	Q9UQK1	317 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	OR10H1	Q9Y4A9	318 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	ASB4	Q9Y574	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RRM2B-209	ENST00000522394	SORL1	Q92673	2214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF716	A6NP11	495 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CCS	O14618	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	GPR171	O14626	319 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	LGI1	O95970	557 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	HPR	P00739	348 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	KRT6B	P04259	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	IFNA6	P05013	189 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	FBP1	P09467	338 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CFHR2	P36980	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	EIF1	P41567	113 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	KRT6C	P48668	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	LINC00523	Q86TU6	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	NMUR2	Q9GZQ4	415 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	RMND5A	Q9H871	391 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394		A0A087X002	238 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	SH2D1B	O14796	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CNTFR	P26992	372 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ELK4	P28324	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	GPR183	P32249	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CDKN2B	P42772	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ARFIP1	P53367	373 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	FOXF1	Q12946	379 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	RIG	Q13278	110 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	P2RY14	Q15391	338 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ZNF573	Q86YE8	665 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CD200R1	Q8TD46	325 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	PEX13	Q92968	403 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OR5B2	Q96R09	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	OR51B5	Q9H339	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RRM2B-209	ENST00000522394	ERVK-18	Q9QC07	812 aa		4.95	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms