RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BBOF1Q8ND07 529 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR5M1Q8NGP8 315 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR2T29Q8NH02 315 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ITFG1Q8TB96 612 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ENKURQ8TC29 256 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ASZ1Q8WWH4 475 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SEC16AO15027 2179 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 A0A0A6YYD5 115 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MPDU1O75352 247 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SCELO95171 688 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRBV12-3P01733 135 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CD28P10747 220 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 APLNRP35414 380 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PCK1P35558 622 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR1G1P47890 313 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CLDN18P56856 261 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR2B8PP59922 312 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR1Q1Q15612 314 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C6orf99Q4VX62 202 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LUZP6Q538Z0 58 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM236Q5W0B7 351 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DEGS2Q6QHC5 323 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CASP12Q6UXS9 341 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 Q6ZSR6 202 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR2Z1Q8NG97 314 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OR1P1Q8NH06 330 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DCAKDQ8WVC6 231 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GPR82Q96P67 336 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 AGMATQ9BSE5 352 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LINC00574Q9H8X3 128 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CD209Q9NNX6 404 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FBXO8Q9NRD0 319 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SIGLEC7Q9Y286 467 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 VGLL3A8MV65 326 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MANBAO00462 879 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 AKR7A2O43488 359 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CATP04040 527 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 THRAP10827 490 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAGEA1P43355 309 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TAS2R43P59537 309 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATP6V0D1P61421 351 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DNAJC3Q13217 504 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IL15RAQ13261 267 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KDM4DQ6B0I6 523 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MED27Q6P2C8 311 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRSS54Q6PEW0 395 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KIF2BQ8N4N8 673 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 AGR3Q8TD06 166 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GLYATL2Q8WU03 294 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM19A4Q96LR4 140 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 EMC6Q9BV81 110 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 WDR19Q8NEZ3 1342 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SVILO95425 2214 aa2.31□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SHROOM3Q8TF72 1996 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ASGR1P07306 291 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KDSRQ06136 332 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM53BQ14153 422 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCL15Q16663 113 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C5orf64Q2M2E5 130 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC30A8Q8IWU4 369 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CMTM8Q8IZV2 173 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRAM1L1Q8N609 369 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GPX8Q8TED1 209 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RXFP2Q8WXD0 754 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM159Q96B96 161 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 S100PBPQ96BU1 408 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RCN3Q96D15 328 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UBE2E2Q96LR5 201 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SFXN3Q9BWM7 321 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LHX5Q9H2C1 402 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 REEP1Q9H902 201 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRSS16Q9NQE7 514 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TREX1Q9NSU2 369 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DDX19BQ9UMR2 479 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 THADAQ6YHU6 1953 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CNMDO75829 334 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FARS2O95363 451 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGKV4-1P06312 121 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TUBG1P23258 451 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IDH2P48735 452 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RAB11AP62491 216 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TSC22D1Q15714 1073 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms