RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ZNF3P17036 446 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GSK3AP49840 483 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GFOD2Q3B7J2 385 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CDONQ4KMG0 1287 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 KLHL12Q53G59 568 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 WDR38Q5JTN6 314 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR2T5Q6IEZ7 315 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 BRICD5Q6PL45 260 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR6N2Q8NGY6 317 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR2T29Q8NH02 315 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 RNF133Q8WVZ7 376 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 INTS14Q96SY0 518 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 AMELYQ99218 206 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 MAGIXQ9H6Y5 334 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 REEP1Q9H902 201 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SP140LQ9H930 580 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 BRD7Q9NPI1 651 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CMC2Q9NRP2 79 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 KPTNQ9Y664 436 aa13.95□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 A0A1B0GVI7 797 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CDIPTO14735 213 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GPR137BO60478 399 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 DCTN3O75935 186 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GSTT1P30711 240 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 IER3P46695 156 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 KRTAP10-3P60369 221 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 RPL15P61313 204 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 MIDNQ504T8 468 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PIGWQ7Z7B1 504 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 DHFR2Q86XF0 187 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 IQCF1Q8N6M8 205 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 LY6G5BQ8NDX9 201 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR52H1Q8NGJ2 320 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OTULINQ96BN8 352 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CITED1Q99966 193 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR10A2Q9H208 303 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ONECUT1Q9UBC0 465 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 RNF114Q9Y508 228 aa13.94□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 B2RBV5 119 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ACOT8O14734 319 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ATP8B1O43520 1251 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 TIPRLO75663 272 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 APOC1P02654 83 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 AMY2BP19961 511 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CFL1P23528 166 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GNALP38405 381 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OPRL1P41146 370 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GYS2P54840 703 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GNGT1P63211 74 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 LCN8Q6JVE9 175 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 LDLRAD3Q86YD5 345 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR10G2Q8NGC3 310 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR5T2Q8NGG2 359 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 LINC01006Q8NI28 216 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 TEX47Q8TBZ9 253 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ITPKCQ96DU7 683 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PGAM5Q96HS1 289 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CCT8L2Q96SF2 557 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa13.93□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 NDUFB3O43676 98 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GLCEO94923 617 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 H2BFMP0C1H6 154 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 TGM4P49221 684 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 MNAT1P51948 309 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GMFBP60983 142 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 MS4A2Q01362 244 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 IKZF1Q13422 519 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OCLNQ16625 522 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 CD300LDQ6UXZ3 194 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 RHOUQ7L0Q8 258 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SHFQ7M4L6 423 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 TIGD4Q8IY51 512 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 GALNT4Q8N4A0 578 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 MICU1Q9BPX6 476 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 TLNRD1Q9H1K6 362 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 OR51V1Q9H2C8 321 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SIRT7Q9NRC8 400 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SNTG1Q9NSN8 517 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 FAM96BQ9Y3D0 163 aa13.92□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 ANXA2P2A6NMY6 339 aa13.91□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 H3BN98 237 aa13.91□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 M0QZ24 198 aa13.91□□□□□ -0.18
HERC3-211ENST00000513325 SELLP14151 372 aa13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.1 ms